Antimicrobial Resistance of E. coli Strains Isolated from Urine Cultures

Year 2024, Volume: 3 Issue: 2, 212 - 219, 18.10.2024

Ahmet Çalışkan , Sedef Zeliha Öner , Melek Demir , İlknur Kaleli , Ergun Mete , Cagri Ergin

Abstract

ABSTRACT: Urinary tract infections (UTIs) are among the most common infectious diseases. This study retrospectively analyzed the antimicrobial resistance rates of E. coli strains isolated from urine culture samples sent to the Pamukkale University Health Research and Application Hospital between July 12, 2023, and July 12, 2024. A total of 1,844 urine culture samples were analyzed. Of the isolates, 68.54% were from female patients, and 31.46% were from male patients. The highest resistance in antibiotic susceptibility tests was observed against drugs such as ampicillin (67.22%), cefazolin (51.62%), and cefuroxime (48.09%). The lowest resistance rates were found against tigecycline (1.12%), ceftazidime-avibactam (1.28%), imipenem, and meropenem (2.28%). Particularly, higher resistance rates to antibiotics were noted in intensive care units, which could be related to the more frequent use of antibiotics in these units. Antibiotics such as tigecycline and ceftazidime-avibactam exhibited relatively low resistance rates in intensive care.

Keywords

Antibiotic Resistance, E. coli, Urinary Tract Infections

References

• Kaye KS, Gupta V, Mulgirigama A, et al. Antimicrobial resistance trends in urine escherichia coli isolates from adult and adolescent females in the united states from 2011 to 2019: Rising ESBL strains and impact on patient management. Clin Infect Dis, 2021;73(11):1992-1999.
• Foxman B. Urinary tract infection syndromes: Occurrence, recurrence, bacteriology, risk factors, and disease burden. Infect Dis Clin North Am. 2014;28(1):1- 13.
• Denk A, Tartar AS. İdrar kültürlerinden izole edilen toplum kökenli Escherichia coli suşlarında antibiyotik direnci. FÜ Sağ Bil Tıp Derg, 2015;29(2):51-5.
• Karamanlıoğlu D, Yıldız PA, Kaya M, Sarı N. İdrar kültürlerinden izole edilen enterik bakterilerde genişlemiş spektrumlu β-laktamaz oluşturma sıklığı ve antibiyotik duyarlılıkları. Klimik Derg, 2019;32(3):233-9. https://doi.org/10.5152/kd.2019.68
• Alpay Y, Yavuz MT, Aslan T, Büyükzengin B. Genişlemiş spektrumlu beta-laktamaz pozitif Escherichia coli ile oluşan komplike olmayan üriner sistem infeksiyonlarının tedavisinde oral antibiyotikler karbapenemlere alternatif olabilir mi? ANKEM Derg, 2017;31(3):85-91. https://doi.org/10.5222/ankem.2017.085
• Özdemir, M, Şentürk Köksal Z. İdrar Yolu Enfeksiyonlarında Ampirik Tedavi Tercihi Ne Olmalı? Black Sea Journal of Health Science, 2024;7(2): 67-72. https://doi.org/10.19127/bshealthscience. 1355586
• The European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing. Breakpoint tables for interpretation of MICs and zone diameters. Version 12.0, 2022. http://www.eucast.org [access date: 20.07.2024]
• Gupta K, Hooton TM, Naber KG, et al. International clinical practice guidelines for the treatment of acute uncomplicated cystitis and pyelonephritis in women: A 2010 update by the Infectious Diseases Society of America and the European Society for Microbiology and Infectious Diseases. Clin Infect Dis, 2011;52(5): e103-120.
• Tuna A, Arslan F, Akkuş İ, ve ark. İdrar Kültürlerinden İzole Edilen Escherichia Coli Suşlarinin Klinikte Sikça Kullanilan Antibiyotiklere Karşi Direnç Oranlarinin Araştirilmasi. Kırıkkale Üniversitesi Tıp Fakültesi Dergisi 2024:26 (1) 1–4.
• Pullukçu H, Aydemir Ş, Taşbakan MI, et al. Is there a rise in resistance rates to fosfomycin and other commonly used antibiotics in Escherichia coli -mediated urinary tract infections ? A perspective for 2004 – 2011. Turk J Med Sci, 2013; 43: 537-41.
• Gündüz A, Mansur A. Ayaktan başvuran hastaların idrar kültürlerinde üretilen Escherichia coli izolatlarında antimikrobiyal direnç oranları: beş yıllık analiz Turk Hij Den Biyol Derg, 2023; 80(1): 23 – 32.
• Aygar İS, Yapalak ZL, Korkmaz Akyüz A, ve ark. Yoğun bakım ünitelerinden beş yıllık bir analiz: Kan kültürlerinden soyutlanan Escherichia coli antibiyotik direnci ne durumda? Turk Mikrobiyol Cemiy Derg. 2023;53(4):265-271.
• Alanlı R, Beşirbellioğlu BA, Çelik G. Toplum kaynaklı üriner enfeksiyon etkeni escherichia coli suşlarında antibiyotik direnci. Hitit Med J. 2021;3(2):1-5. DOI: 10.52827/hititmedj.888932.
• Mashni O, Nazer L, Le J. Critical Review of Double-Carbapenem Therapy for the Treatment of Carbapenemase-Producing Klebsiella pneumoniae. The Annals of pharmacotherapy, 2019;53(1): 70–81. Doi: 10.1177/1060028018790573.
• Bilgin M, İşler H, Başbulut E, Görgün S. Genişlemiş Spektrumlu Beta-Laktamaz Üreten Enterobacteriaceae İzolatlarına Karşı Seftazidim- Avibaktam’ın in Vitro Etkinliğinin Araştırılması. Journal of Immunology and Clinical Microbiology, 2023;8(1):17-23.
• Yüksek G, Memiş N, Öksüz Ş. İdrar Örneklerinden İzole Edilen Escherichia coli Kökenlerinin Antibiyotik Duyarlılığı. Düzce Üniversitesi Sağlık Bilimleri Enstitüsü Dergisi. 2021;11(2): 137–142.