BATI ANADOLU’DAKİ BAZI YAYGIN KÜÇÜK MEMELİ TÜRLERİNİN ORTOHANTAVİRÜS TAŞIYICILIĞI AÇISINDAN DEĞERLENDİRİLMESİ

Year 2024, , 30 - 36, 30.08.2024

Ceylan Polat , Sercan Irmak , Mustafa Sözen , Mehmet Ali Öktem

https://doi.org/10.54962/ankemderg.1458626

Abstract

Hantaviridae ailesinin üyesi olan ortohantavirüsler, kemirici kaynaklı RNA virüsleridir. Enfekte kemiricilerin çıkartı ve sekresyonlarındaki viral partiküllerin aerosolizasyonu ve nadiren de enfekte kemiricilerle direkt temas yolu ile bulaşan ortohantavirüsler, Avrasya'da renal sendromlu kanamalı ateş ve epidemik nefropati olgularına, Amerika kıtasında ise hantavirüs kardiyopulmoner sendrom olgularına neden olabilen önemli halk sağlığı sorunlarıdır. Türkiye’de de enfeksiyonlara neden oldukları bildirilmiş ve küçük memelilerdeki varlıkları gösterilmiştir.
Bu çalışma ile renal sendromlu kanamalı ateş olgularının bildirildiği bazı Batı Anadolu illerinde dolaşımda olan ortohantavirüslerin ve olası konak türlerinin belirlenmesi amaçlanmıştır. Çalışma kapsamında yedi farklı lokaliteden yakalanan 49 adet küçük memeliye ait serum ve akciğer dokusu örnekleri kullanılmıştır. Hem moleküler hem de serolojik yöntemler ile taranan örneklerde, Ortohantavirüs enfeksiyonuna yönelik bir pozitiflik saptanmamıştır. Bu durum, örneklem alanlarının zamansal, bölgesel ve iklimsel özelliklerinden kaynaklanmış olabilir.
Batı Anadolu’daki küçük memelilerin Ortohantavirüs taşıyıcılıklarının değerlendirilmesi, bölgeden bildirilmiş vakalar olması nedeniyle önem taşımaktadır. Bu çalışmanın örneklemi sınırlı

Keywords

Orthohantavirus, Microtus, Apodemus, Crocidura, Anadolu, Türkiye

Ethical Statement

Çalışma planı, Dokuz Eylül Üniversitesi, Hayvan Deneyleri Yerel Etik Kurulu (28/2016 numaralı karar) tarafından onaylanmıştır.

Thanks

Araştırmanın saha çalışmalarına katkı sağlayan Dr. Ortaç Çetintaş ve Prof. Dr. Ferhat Matur’a teşekkürlerimizi sunarız.

Evaluation of Some Common Small Mammal Species in Western Anatolia for Orthohantavirus Carriage

Abstract

Orthohantaviruses, members of the Hantaviridae family, are rodent-borne RNA viruses. They transmitted by aerosolization of viral particles in the excretions and secretions of infected rodents and rarely by direct contact with infected rodents. They are an important public health concerns that cause hemorrhagic fever with renal syndrome and epidemic nephropathy cases in Eurasia and hantavirus cardiopulmonary syndrome cases in the Americas. They have also been reported to cause infections in Turkey and their presence in rodents have been indicated.
We aimed to determine the circulating orthohantaviruses and possible host species in some provinces of Western Anatolia where hemorrhagic fever with renal syndrome cases have been reported. Serum and lung tissue samples of 49 rodents collected from seven localities during a one-week field study were used. No positivity for Orthohantavirus infection was detected in the samples screened by both molecular and serologic methods. This situation may be related to the temporal, regional and climatic characteristics of the sampling areas.
The evaluation of rodents in Western Anatolia in terms of Orthohantavirus carriage is important due to the cases reported from the region. Since the sample size of this study was limited, a comprehensive study which includes possible host rodent species and samples collected from different periods is needed.

Keywords

Orthohantavirus, Microtus, Apodemus, Crocidura, Anatolia, Turkey

Ethical Statement

The study plan was approved by the Local Ethics Committee for Animal Experiments (decision number 28/2016) of Dokuz Eylul University.

References

• 1. Akar N, Çalişkan E, Öztürk CE, et al. Seroprevalence of hantavirus and Borrelia burgdorferi in Düzce (Turkey) forest villages and the relationship with sociodemographic features. Turk J Med Sci. 2019;49(2):483-9. doi: 10.3906/sag-1807-160
• 2. Cesur S, Unverdi S, Ciftci A, et al. The seroprevalence of hantavirus in patients with chronic renal failure in two provinces of Central Anatolia. KLIMIK Derg. 2012;25(3):103-6. doi:10.5152/kd.2012.29
• 3. Chomczynski P, Sacchi N. The single-step method of RNA isolation by acid guanidinium thiocyanate-phenol-chloroform extraaction: twenty- something years on. Nat Protoc. 2006;1(2):581-5. doi:10.1038/nprot.2006.83
• 4. Çelebi G, Öztoprak N, Öktem İMA, et al. Dynamics of Puumala hantavirus outbreak in Black Sea Region, Turkey. Zoonoses Public Health. 2019;66(7): 783-97. doi: 10.1111/zph.12625
• 5. Erdin M, Stanoeva KR, Mögling R, et al. External quality assessment of orthohantavirus and lymphocytic choriomeningitis virus molecular detection and serology in Europe, 2021. Euro Surveill. 2023;28(40):pii=2300054. doi:10.2807/1560-7917.ES.2023.28.40.2300054
• 6. Ertek M, Buzgan T. An outbreak caused by hantavirus in the Black Sea region of Turkey, January-May 2009. Euro Surveill. 2009;14(20):19214. doi: 10.2807/ese.14.20.19214-en
• 7. Gozalan A, Kalaycioglu H, Uyar Y, et al. Human Puumala and Dobrava hantavirus infections in the black sea region of Turkey: A cross-sectional study. Vector Borne Zoonotic Dis. 2013;13(2):111-8. doi: 10.1089/vbz.2011.0939
• 8. Gözel MG, Engin A, Elaldi N, Bakir M, Dökmetaş I, Uyar Y. First cases of hemorrhagic fever with renal syndrome from the Middle Anatolia Region of Turkey and the first case of hantavirus and crimean-congo hemorrhagic fever virus co-infection in a patient. Turkiye Klinikleri J Med Sci. 2013;33(1):224-8. doi: 10.5336/medsci.2011-22742
• 9. Jonsson CB, Figueiredo LTM, Vapalahti O. A global perspective on hantavirus ecology, epidemiology, and disease. Clin Microbiol Rev. 2010;23(2):412-41. doi: 10.1128/CMR.00062-09
• 10. Kaya S, Yilmaz G, Erensoy Ş, Yaǧçi Çaǧlayik D, Uyar Y, Köksal I. Hantavirus infection: Two case reports from a province in the Eastern Black Sea Region, Turkey. Mikrobiyol Bul. 2010;44(3):479-87.
• 11. Klein SL, Calisher CH. Emergence and persistence of hantaviruses. Curr Top Microbiol Immunol. 2007;315:217-52. doi: 10.1007/978-3-540-70962-6_10
• 12. Klempa B, Fichet-Calvet E, Lecompte E, et al. Hantavirus in African wood mouse, Guinea. Emerg Infect Dis. 2006;12(5):838-40. doi: 10.3201/eid1205.051487
• 13. Laakkonen J, Kallio-Kokko H, Öktem MA, et al. Serological survey for viral pathogens in Turkish rodents. J Wildl Dis. 2006;42(3): 672-6. doi: 10.7589/0090-3558-42.3.672
• 14. Oktem IMA, Uyar Y, Dincer E, et al. Dobrava-belgrade virus in Apodemus flavicollis and A. uralensis mice, Turkey. Emerg Infect Dis. 2014;20(1):121-5. doi: 10.3201/eid2001.121024
• 15. Oncul O, Atalay Y, Onem Y, et al. Hantavirus infection in Istanbul, Turkey. Emerg Infect Dis. 2011;17(2): 303-4. doi: 10.3201/eid1702.100663
• 16. Ozkan O, Tukek T, Yildiz E, Ayozturk Velioglu E, Gursu M, Ozturk S. Hantavirus infections and renal manifestations: Case report and update. Turkish J Nephrol. 2013;22(1):129-32. doi: 10.5262/tndt.2013.1001.23
• 17. Polat C, Karataş A, Sözen M, Matur F, Abacıoglu H, Öktem MA. Yabani kemiricilerde Eski Dünya Hantavirüs IgG antikorlarının saptanması için ELISA ve immunoblot yöntemlerinin optimizasyonu. Mikrobiyol Bul. 2016; 50(2):245-55. doi: 10.5578/mb.23161
• 18. Polat C, Sironen T, Plyusnina A, et al. Dobrava hantavirus variants found in Apodemus flavicollis mice in Kırklareli province, Turkey. J Med Virol. 2018;90(5):810-8. doi: 10.1002/jmv.25036
• 19. Polat C, Ergünay K, Irmak S, et al. A novel genetic lineage of Tula orthohantavirus in Altai voles (Microtus obscurus) from Turkey. Infect Genet Evol. 2019;67:150-8. doi: 10.1016/j.meegid.2018.11.015
• 20. Polat C, Ergin Ç, Akkaya Y, Oktem IMA. Investigation of Orthohantavirus seroprevalence in northern rural areas of Denizli Province, Turkey. Jpn J Infect Dis. 2020;73(3):201-4. doi: 10.7883/yoken.JJID.2019.330
• 21. Sarigüzel N, Hofmann J, Canpolat AT, et al. Dobrava hantavirus infection complicated by panhypopituitarism, Istanbul, Turkey, 2010. Emerg Infect Dis. 2012;18(7):1180-3. doi: 10.3201/eid1807.111746
• 22. Sikkema RS, Koopmans MPG. Preparing for emerging zoonotic viruses, “Bamford DH, Zuckerman M (eds): Encyclopedia of Virology, 4. baskı” kitabında s. 256-66, Academic Press, London (2021) doi: 10.1016/B978-0-12-814515-9.00150-8.
• 23. T.C. Sağlık Bakanlığı Halk Sağlığı Genel Müdürlüğü. Türkiye Zoonotik Hastalıklar Eylem Planı, 1. baskı, Artı6 Medya Tanıtım Matbaa Ltd. Şti., Ankara (2019).
• 24. Tersago K, Verhagen R, Vapalahti O, Heyman P, Ducoffre G, Leirs H. Hantavirus outbreak in Western Europe: reservoir host infection dynamics related to human disease patterns. Epidemiol Infect. 2011;139(3):381-90. doi: 10.1017/S0950268810000956
• 25. Uyar Y, Caglayik DY, Korukluoglu G, et al. Investigation of hantavirus infections among CCHFV negative cases in the Western Black Sea Region of Turkey. Acta Med Mediterr. 2014;30(4):855-60.
• 26. Vaheri A, Henttonen H, Voutilainen L, Mustonen J, Sironen T, Vapalahti O. Hantavirus infections in Europe and their impact on public health. Rev Med Virol. 2013;23(1):35-49. doi: 10.1002/rmv.1722