Tekirdağ ilinde kirazda Bakteriyel kanser hastalığına neden olan hastalık etmenlerinin karakterizasyonu

Year 2016, Volume: 56 Issue: 4, 385 - 397, 31.12.2016

Mustafa Mirik , Cansu Öksel Merve Özdemir

Abstract

Kiraz (Prunus avium L.) Tekirdağ’da yetiştirilen önemli bir meyve
türüdür. Kirazda verim ve
kaliteyi düşüren, ağaçları kurutan bakteriyel
kanser hastalığı etmen(ler)i bu çalışma ile
araştırılmıştır. Tekirdağ ili kiraz bahçelerinde 2012-2013 yıllarında gerçekleştirilen sürvey
araştırmaları sonucu 150 hasta bitki örneği
belirti gösteren ağaçlardan toplanmıştır. Tekirdağ ilinde
surveye dahil edilen bahçelerin
tümünde hastalığın görüldüğü hastalık oranının %20-57, hastalık şiddetinin ise %20-85 oranında
olduğu tespit edilmiştir. Laboratuvarda yapılan
izolasyon çalışmaları sonucu, bu örneklerden 60 adet Pseudomonas syringae
izolatı elde edilmiştir. Yapılan
LOPAT testleri sonucunda izolatlar oksidaz, pektolitik aktivite, arginin
dehidrolaz negatif, tütünde aşırı duyarlılık ve levan pozitif olarak
değerlendirilmiştir. Test edilen
izolatların GATTa özellikleri, Pseudomonas syringae pv. syringae
olarak tanılanan 32 izolat için (+
+- -) olarak kaydedilirken
Pseudomonas syringae pv. morsprunorum olarak tanılanan 28 izolat için (- -+ +) olarak bulunmuştur. Tesadüfen seçilen izolatlar yağ
asidi analizlerine göre %62-90 oranında benzerlik göstermiştir. Moleküler
testlerde kullanılan spesifik primerler ile 28 adet izolat 650 bp
tekrarlanabilir bant oluşturarak P. syringae pv. morsprunorum ve
32 adet izolat 752 bp tekrarlanabilir bant oluşturması nedeniyle P. syringae
pv. syringae olarak tanılanmıştır.

Keywords

Cerasus avium, Pseudomonas syringae pv. syringae, Pseudomonas syringae pv. morsprunorum, cfl, syrB

Characterization of causal agents of bacterial canker on sweet cherry trees in Tekirdağ province

Abstract

Sweet cherry (Prunus
avium L.) is one of the most important fruit trees grown in Tekirdağ. Causal disease agent(s) of bacterial canker which
reduces yield and quality of sweet cherry fruit and cause death of trees were
investigated. For this purpose a survey study was conducted in 2012-2013 and
150 infected plant samples were collected from symptomatic trees. As a result
of survey studies, bacterial canker was determined in all orchards, while the
prevalence rate of diseases was determined as 20-57%
and its severity estimated as 20-85% in
surveyed orchards. As a result of isolation studies, 60 bacterial isolates of Pseudomonas syringae were obtained.
Results obtained from LOPAT, oxidase, pectolytic activity and arginine
dihydrolase revealed that all isolates were recorded as negative for oxidase,
pectolytic activity and arginine dihydrolase, but were positive on tobacco and
levan production. Further GATTa characters of tested isolates were found as (+
+ - -) for 28 isolates identified as Pseudomonas syringae pv. morsprunorum, while
32 isolates were recorded as (- - + +), identified as Pseudomonas
syringae pv. syringae.
Coincidentally 62-90% of selected isolates showed similarity according to fatty
asit methyl ester analaysis. By using specific primers, 28 isolates formed 650
bp repeatable band so identified as Pseudomonas syringae pv. morsprunorum,
32 isolates formed 752 bp repeatable
band so identified as Pseudomonas syringae pv. syringae.

Keywords

Cerasus avium, Pseudomonas syringae pv. syringae, Pseudomonas syringae pv. morsprunorum, cfl, syrB

References

• Abbasi V., Rahimian H. and Tajick-Ghanbari M.A. 2013. Genetic variability of Iranian strains of Pseudomonas syringae pv. syringae causing bacterial canker disease of stone fruits. European Journal of Plant Pathology, 135, 225-235.