Research Article
BibTex RIS Cite

Year 2020, Volume: 4 Issue: 3, 46 - 54, 27.11.2020

Gülfem Ece , Cem Ece , Deniz Aslan

Abstract

Aim: Intensive care units (ICUs) are the most common units where hospital infections take place mostly due to both the characteristics of the patients, the administered treatment, and invasive procedures. ICU’s are one of the most common departments of the hospital where pneumonia takes place. In lower respiratory tract infections often; Pseudomonas and Acinetobacter bacteria are isolated as pathogens. In our study, it was aimed to investigate the Acinetobacter baumannii and Pseudomonas aeruginosa rate, antimicrobial resistance profile, and the factors affecting prognosis in the lower respiratory tract samples of patients hospitalized in the intensive care unit.
Materials and Methods: In our retrospective study, 505 patients in the tertiary intensive care unit and a total of 2740 non-fermentative gram negative bacterials trains isolated from the lower respiratory tract samples of these patients were included. Identification and antibiotic susceptibilities of isolates were studied with Phoenix TM 100 (BD, USA) according to EUCAST standards. Demographic, clinical and laboratory data of the patients were obtained from the hospital automation system. SPPS 20.0 statistics package program was used to evaluate the data. Variables were used as mean ± standard deviation and Median (Maximum-Minimum) percentage and frequency values. p <0.05 was considered significant.
Results: 560 P.aeruginosa and 694 A.baumannii were isolated out of 2740 tracheal aspirate samples. The most resistant antibiotics were amikacin and gentamicin for P.aeruginosa strains and on the other hand ciprofloxacin and carbapenem group antibiotics were the most resistant ones for A. Baumannii strains. There was a statistically significant difference in intubation, length of stay and prognosis between Acinetobacter and Pseudomonas groups.
Conclusion: One of the most important issues are the lower tract infections and antimicrobial resistance in ICUs. The demographic data, underlying disorders of the patients and extended spectrum antibiotic use have contributed to antibiotic resistance and because of this the estimation of the antimicrobial profile is essential in cases when there is no time to wait for the antisusceptibility results and immediately begin empirical treatment.

Keywords

P. aeruginosa A.baumannii intensive care unit lower respiratory tract infection

References

  • 1. Arman D. Yoğun bakım infeksiyonlarının önemi ve epidemiyolojisi. Yoğun Bakım Dergisi 2006;6:5-7.
  • 2. Siegel J, Rhinehart E, Jackson M, Chiarello L. Guideline for isolation precautions: preventing transmission of infectious agents in health care settings 2007. In: committee Thicpa, ed, Vol CDC, 2007.
  • 3. Gazi H, Sürücüoğlu S, Kurutepe S, İnmez E, Dinç G, Özbakkaloğlu B. Yoğun bakım ünitesi ve diğer ünitelerde yatan hastalardan izole edilen Acinetobacter baumannii suşlarında in-vitro antibiyotik direnci. Ankem Dergisi 2005;19:115 - 18.
  • 4. Giamarellou H, Antoniadou A, Kanellakopoulou K. Acinetobacter baumannii: A universal threat to public health? Int J Antimicrob Agents 2008;32:106-19.
  • 5. Fadda G, Spanu T, Ardito F, et al. Antimicrobial resistance among non-fermentative Gram-negative bacilli isolated from the respiratory tracts of Italian in patients: a 3-year surveillance study by the Italian Epidemiological Survey. Int J Antimicrob Agents 2004;23:254-61
  • 6. Karageorgopoulos DE, Falagas ME. Current control and treatment of multi drug-resistant Acinetobacter baumannii infections. Lancet Infect Dis 2008;8:751-62.
  • 7. Sümerkan B. Yoğun bakım ünitesinde Gram-negatif mikroorganizmalar ve direnç sorunu. Yoğun Bakım Dergisi 2003;3:129-34.
  • 8. Jones RN, Sader HS, Beach ML. Contemporary in vitrospectrum of activity summary for antimicrobial agents tested against 18569 strains non-fermentative Gram negative bacilli isolated in the SENTRY Antimicrobial Surveillance Program (1997-2001). Int J Antimicrob Agents 2003;22:551-56.
  • 9. Unal S, Garcia-Rodriguez JA. Activity of meropenem and comparators against Pseudomon asaeruginosa and Acinetobacter spp. isolated in the MYSTIC Program, 2002-2004. Diagn Microbiol Infect Dis 2005;53:265-71.
  • 10. Azap Ö, Timur kaynak F, Arslan H, Karaman S. Hastane infeksiyon etkeni olarak izole edilen non–fermentatif Gram negatif bakterilerde siprofloksasin, ofloksasin ve Levofloksasinin in–vitro etkinliğinin karşılaştırılması. Ankara Üniversitesi Tıp Fakültesi Mecmuası 2004;57:189-94.
  • 11. Turner PJ. MYSTIC Europe 2007: Activity of meropenem and other broad-spectrum agents against nosocomial isolates. Diagn Microbiol Infect Dis 2009;63:217-22.
  • 12. Pinheiro MR, Lacerda HR, Melo RG, Maciel MA. Pseudomon asaeruginosa infections: factors relating to mortality with emphasis on resistance pattern and antimicrobial treatment. Braz J InfectDis 2008;12:509-15
  • 13. Orucu M, Geyik M. Yoğun bakım ünitesinde sık görülen infeksiyonlar. Düzce Tıp Fakültesi Dergisi 2008;1:40-43.
  • 14. Salmanov A.G., Voronenko Y.V., Sergiy O, Vozianov et al. Blood stream infections and antimicrobial resistance of responsible pathogens in Ukraine: results of a multicenter study (2013-2015) WiadLek 2019;72(11 cz 1):2069-75
  • 15. Hamzeh A, Rezaee P, Mohammadi M. Acinetobacter baumannii antibiotics resistance in Iran. J Bacteriol Mycol Open Access. 2019;7(6):159‒62.
  • 16. Kurtoğlu MG, Opus A, Kaya M, Keşli R, Güzelant A, Yüksekkaya Ş. Bir eğitim ve araştırma hastanesinde klinik örneklerden izole edilen Acinetobacter baumannii suşlarında antibakteriyel direnç (2008-2010). ANKEM Derg 2011;25:35-41.
  • 17. Şanal L, Kılıç H. Yoğun Bakım Ünitesinde Yatan Hastaların Kan Kültürlerinden İzole Edilen Acinetobacter baumannii Suşlarında Antimikrobiyal Direnç. Ortadoğu Tıp Dergisi 2014;3:105- 110.
  • 18. Cesur S. at al. Yoğun bakım ünitesinde yatan hastaların çeşitli kültür örneklerinden izole edilen Acinetobacter baumannii suşlarının antibiyotik duyarlılıkları ORTADOĞU TIP DERGİSİ 9 (2):2017 51-5
  • 19. İnce N, Geyik MF, Özdemir D, ve ark. Hastane infeksiyonu etkeni olan Pseudomon asaeruginosa suşlarının yıllara göre antibiyotik duyarlılıklarının karşılaştırılması. ANKEM Derg 2014;28:94-9.
  • 20. Gür D, Hascelik G, Aydin N, et al. Antimicrobial resistance in gram-negative hospital isolates: results of the Turkish HITIT-2 Surveillance Study of 2007. J Chemother 2009;21:3:83-9.
  • 21. Rhomberg PR, Jones RN. Contemporary activity of meropenem and comparator broad-spectrum agents: MYSTIC program report from the United States component (2005). Diagn Microbiol Infect Dis 2007;57:207-15.
  • 22. Turner PJ. MYSTIC Europe 2007: Activity of meropenem and other broad-spectrum agents against nosocomial isolates. Diagn Microbiol Infect Dis 2009;63:217-22.
  • 23. Zhanel GG, DeCorby M, Laing N, et al. Antimicrobial resistant pathogens in intensive care units in Canada: Results of the Canadian National Intensive Care Unit (CAN-ICU) Study, 2005-2006. Antimicrob Agents Chemother 2008;52:1430-37.
  • 24. Mendes C, Oplustil C, Sakagami E, et al; MYSTIC Brazil Group. Antimicrobial susceptibility in intensive care units: MYSTIC Program Brazil 2002. Braz J Infect Dis 2005;9:44-51.
  • 25. Tan R, Liu J, Li M, et al. Epidemiology and antimicrobial resistance among commonly encountered bacteria associated with infections and colonization in intensive care units in a university-affiliated hospital in Shanghai. J Microbiol Immunol Infect 2014;47:87-94.
  • 26. Alışkan H, Çolakoğlu Ş, Turunç T, ve ark. Yoğun bakım ve servis hastalarından izole edilen Pseudomon asaeruginosa ve Acinetobacter baumannii izolatlarının antibiyotik duyarlılık oranlarının dört yıllık izlemi. Mikrobiyol Bul 2008;42:321-29.
  • 27. Yüce A, Yapar N, Eren Kutsoylu O. İzmir Dokuz Eylül Üniversite Hastanesi yoğun bakım hastalarından izole edilen Pseudomon asaeruginosa ve Acinetobacter spp. suşlarının 2000-2002 ve 2003-2006 yıllarında saptanan antibiyotik duyarlılık paternlerinin değerlendirilmesi. Mikrobiyol Bul 2009;43;195-02
  • 28. Lob SH, Hoban DJ, Sahm DF, Badal RE. Regional differences and trends in antimicrobial susceptibility of Acinetobacter baumannii. Int J Antimicrob Agents 2016;47:317-23
  • 29. Uğur M, Genç S. Yoğun Bakım Ünitelerinden İzole Edilen Acinetobacter baumannii ve Pseudomon asaeruginosa Suşlarının Üç Yıllık Direnç Profili Turk J Intensive Care 2019;17:130-7

YOĞUN BAKIM HASTALARI ALT SOLUNUM YOLU ÖRNEKLERİNDE İZOLE EDİLEN Acinetobacter baumannii VE Pseudomonas aeruginosa SUŞLARININ ANTİMİKROBİYAL DİRENÇ PROFİLİNİN VE RİSK FAKTÖRLERİNİN İNCELENMESİ

Year 2020, Volume: 4 Issue: 3, 46 - 54, 27.11.2020

Gülfem Ece , Cem Ece , Deniz Aslan

Abstract

Amaç: Yoğun bakım üniteleri (YBÜ) gerek yatan hasta grubunun özellikleri gerekse uygulanan tedavi ve invaziv işlemler nedeniyle hastane enfeksiyonlarının en sık görüldüğü birimlerdir. YBÜ’leri özellikle özellikle nozokomiyal pnömonin en sık görüldüğü yerler arasındadır. YBÜ’de gelişen alt solunum yolu enfeksiyonlarında sıklıkla; Pseudomonas ve Acinetobacter cinsi bakteriler etken olarak izole edilir. Çalışmamızda yoğun bakım kliniğinde yatan hastaların alt solunum yolu örneklerinde üreyen Acinetobacter baumannii ve Pseudomonas aeruginosa üreme oranı, antimikrobial direnç profilinin incelenmesi ve prognoza etki eden faktörlerinin değerlendirilmesi amaçlandı.
Gereç ve Yöntemler: Retrospektif yaptığımız çalışmamıza üçüncü basamak yoğun bakım biriminde yatan 505 hasta ve bu hastaların alt solunum yolu örneklerinden izole edilmiş toplam 2740 nonfermantatif Gram negatif bakteri izolatı alındı. İzolatların identifikasyonu ve antibiyotik duyarlılıkları EUCAST standartlarına göre Phoenix 100 (BD, USA) ile çalışıldı. Hastalara ait demografik, klinik ve laboratuvar verileri hastane otomasyon sisteminden elde edildi. Verilerin değerlendirilmesinde SPPS 20.0 istatistik paket programı kullanıldı. Değişkenler ortalama±standart sapma ve Medyan (Maksimum-Minumum) yüzde ve frekans değerleri kullanıldı. p<0.05 anlamlı kabul edildi.
Bulgular: Toplam 2740 trakealaspirat örneğinin 560’ında P.aeruginosa ve 694’ünde A.baumannii izole edildi. P.aeruginosa izolatlarında en yüksek direnç oranı amikasin ve gentamisine iken, A.baumannii suşlarında siprofloksasin ve karbapenem grubu antibiyotiklere saptandı. Acinetobacter ve Pseudomonas türleri arasında entübasyon, yatış süreleri ve prognoz olarak istatistiksel anlamlı farklılık saptandı.
Sonuç: Yoğun bakım ünitelerinde alt solunum yolu enfeksiyonları ve antimikrobiyal direnç önemlidir. Demografik veriler, hastaların altta yatan bozuklukları ve geniş spektrumlu antibiyotik kullanımı antibiyotik direncine katkıda bulunmaktadır. Bu nedenle antimikrobiyal direnç profilinin bilinmesi, hızlı ve ampirik tedaviye başlamada önemlidir.

Keywords

P. Aeruginosa yoğun bakım alt solunum yolu enfeksiyonu A.baumannii

References

  • 1. Arman D. Yoğun bakım infeksiyonlarının önemi ve epidemiyolojisi. Yoğun Bakım Dergisi 2006;6:5-7.
  • 2. Siegel J, Rhinehart E, Jackson M, Chiarello L. Guideline for isolation precautions: preventing transmission of infectious agents in health care settings 2007. In: committee Thicpa, ed, Vol CDC, 2007.
  • 3. Gazi H, Sürücüoğlu S, Kurutepe S, İnmez E, Dinç G, Özbakkaloğlu B. Yoğun bakım ünitesi ve diğer ünitelerde yatan hastalardan izole edilen Acinetobacter baumannii suşlarında in-vitro antibiyotik direnci. Ankem Dergisi 2005;19:115 - 18.
  • 4. Giamarellou H, Antoniadou A, Kanellakopoulou K. Acinetobacter baumannii: A universal threat to public health? Int J Antimicrob Agents 2008;32:106-19.
  • 5. Fadda G, Spanu T, Ardito F, et al. Antimicrobial resistance among non-fermentative Gram-negative bacilli isolated from the respiratory tracts of Italian in patients: a 3-year surveillance study by the Italian Epidemiological Survey. Int J Antimicrob Agents 2004;23:254-61
  • 6. Karageorgopoulos DE, Falagas ME. Current control and treatment of multi drug-resistant Acinetobacter baumannii infections. Lancet Infect Dis 2008;8:751-62.
  • 7. Sümerkan B. Yoğun bakım ünitesinde Gram-negatif mikroorganizmalar ve direnç sorunu. Yoğun Bakım Dergisi 2003;3:129-34.
  • 8. Jones RN, Sader HS, Beach ML. Contemporary in vitrospectrum of activity summary for antimicrobial agents tested against 18569 strains non-fermentative Gram negative bacilli isolated in the SENTRY Antimicrobial Surveillance Program (1997-2001). Int J Antimicrob Agents 2003;22:551-56.
  • 9. Unal S, Garcia-Rodriguez JA. Activity of meropenem and comparators against Pseudomon asaeruginosa and Acinetobacter spp. isolated in the MYSTIC Program, 2002-2004. Diagn Microbiol Infect Dis 2005;53:265-71.
  • 10. Azap Ö, Timur kaynak F, Arslan H, Karaman S. Hastane infeksiyon etkeni olarak izole edilen non–fermentatif Gram negatif bakterilerde siprofloksasin, ofloksasin ve Levofloksasinin in–vitro etkinliğinin karşılaştırılması. Ankara Üniversitesi Tıp Fakültesi Mecmuası 2004;57:189-94.
  • 11. Turner PJ. MYSTIC Europe 2007: Activity of meropenem and other broad-spectrum agents against nosocomial isolates. Diagn Microbiol Infect Dis 2009;63:217-22.
  • 12. Pinheiro MR, Lacerda HR, Melo RG, Maciel MA. Pseudomon asaeruginosa infections: factors relating to mortality with emphasis on resistance pattern and antimicrobial treatment. Braz J InfectDis 2008;12:509-15
  • 13. Orucu M, Geyik M. Yoğun bakım ünitesinde sık görülen infeksiyonlar. Düzce Tıp Fakültesi Dergisi 2008;1:40-43.
  • 14. Salmanov A.G., Voronenko Y.V., Sergiy O, Vozianov et al. Blood stream infections and antimicrobial resistance of responsible pathogens in Ukraine: results of a multicenter study (2013-2015) WiadLek 2019;72(11 cz 1):2069-75
  • 15. Hamzeh A, Rezaee P, Mohammadi M. Acinetobacter baumannii antibiotics resistance in Iran. J Bacteriol Mycol Open Access. 2019;7(6):159‒62.
  • 16. Kurtoğlu MG, Opus A, Kaya M, Keşli R, Güzelant A, Yüksekkaya Ş. Bir eğitim ve araştırma hastanesinde klinik örneklerden izole edilen Acinetobacter baumannii suşlarında antibakteriyel direnç (2008-2010). ANKEM Derg 2011;25:35-41.
  • 17. Şanal L, Kılıç H. Yoğun Bakım Ünitesinde Yatan Hastaların Kan Kültürlerinden İzole Edilen Acinetobacter baumannii Suşlarında Antimikrobiyal Direnç. Ortadoğu Tıp Dergisi 2014;3:105- 110.
  • 18. Cesur S. at al. Yoğun bakım ünitesinde yatan hastaların çeşitli kültür örneklerinden izole edilen Acinetobacter baumannii suşlarının antibiyotik duyarlılıkları ORTADOĞU TIP DERGİSİ 9 (2):2017 51-5
  • 19. İnce N, Geyik MF, Özdemir D, ve ark. Hastane infeksiyonu etkeni olan Pseudomon asaeruginosa suşlarının yıllara göre antibiyotik duyarlılıklarının karşılaştırılması. ANKEM Derg 2014;28:94-9.
  • 20. Gür D, Hascelik G, Aydin N, et al. Antimicrobial resistance in gram-negative hospital isolates: results of the Turkish HITIT-2 Surveillance Study of 2007. J Chemother 2009;21:3:83-9.
  • 21. Rhomberg PR, Jones RN. Contemporary activity of meropenem and comparator broad-spectrum agents: MYSTIC program report from the United States component (2005). Diagn Microbiol Infect Dis 2007;57:207-15.
  • 22. Turner PJ. MYSTIC Europe 2007: Activity of meropenem and other broad-spectrum agents against nosocomial isolates. Diagn Microbiol Infect Dis 2009;63:217-22.
  • 23. Zhanel GG, DeCorby M, Laing N, et al. Antimicrobial resistant pathogens in intensive care units in Canada: Results of the Canadian National Intensive Care Unit (CAN-ICU) Study, 2005-2006. Antimicrob Agents Chemother 2008;52:1430-37.
  • 24. Mendes C, Oplustil C, Sakagami E, et al; MYSTIC Brazil Group. Antimicrobial susceptibility in intensive care units: MYSTIC Program Brazil 2002. Braz J Infect Dis 2005;9:44-51.
  • 25. Tan R, Liu J, Li M, et al. Epidemiology and antimicrobial resistance among commonly encountered bacteria associated with infections and colonization in intensive care units in a university-affiliated hospital in Shanghai. J Microbiol Immunol Infect 2014;47:87-94.
  • 26. Alışkan H, Çolakoğlu Ş, Turunç T, ve ark. Yoğun bakım ve servis hastalarından izole edilen Pseudomon asaeruginosa ve Acinetobacter baumannii izolatlarının antibiyotik duyarlılık oranlarının dört yıllık izlemi. Mikrobiyol Bul 2008;42:321-29.
  • 27. Yüce A, Yapar N, Eren Kutsoylu O. İzmir Dokuz Eylül Üniversite Hastanesi yoğun bakım hastalarından izole edilen Pseudomon asaeruginosa ve Acinetobacter spp. suşlarının 2000-2002 ve 2003-2006 yıllarında saptanan antibiyotik duyarlılık paternlerinin değerlendirilmesi. Mikrobiyol Bul 2009;43;195-02
  • 28. Lob SH, Hoban DJ, Sahm DF, Badal RE. Regional differences and trends in antimicrobial susceptibility of Acinetobacter baumannii. Int J Antimicrob Agents 2016;47:317-23
  • 29. Uğur M, Genç S. Yoğun Bakım Ünitelerinden İzole Edilen Acinetobacter baumannii ve Pseudomon asaeruginosa Suşlarının Üç Yıllık Direnç Profili Turk J Intensive Care 2019;17:130-7
There are 29 citations in total.

Details

Primary Language Turkish
Subjects Clinical Sciences
Journal Section RESEARCH ARTICLE
Authors

Gülfem Ece 0000-0003-4869-8199

Cem Ece 0000-0002-5786-0525

Deniz Aslan 0000-0003-3746-918X

Publication Date November 27, 2020
Published in Issue Year 2020 Volume: 4 Issue: 3

Cite

APA Ece, G., Ece, C., & Aslan, D. (2020). YOĞUN BAKIM HASTALARI ALT SOLUNUM YOLU ÖRNEKLERİNDE İZOLE EDİLEN Acinetobacter baumannii VE Pseudomonas aeruginosa SUŞLARININ ANTİMİKROBİYAL DİRENÇ PROFİLİNİN VE RİSK FAKTÖRLERİNİN İNCELENMESİ. Balıkesir Medical Journal, 4(3), 46-54.
 Download Cover Image

Creative Commons License
This work is licensed under a Creative Commons Attribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 International License.