Turunçgil Sarı Damar Açılması Virüs (TSDAV) Hastalığının Farklı Turunçgil Türlerinde Moleküler Olarak Tanılanması*

Year 2016, Volume: 31 Issue: 2, 51 - 58, 29.07.2016

Abdulkadir Bozdoğan Nüket Önelge

Abstract

Bu çalışmada Turunçgil sarı damar açılması virüs (TSDAV) hastalığı; hastalık simptomlarının gözlenebildiği limon ve turunç türleri ile simptomların görülmediği portakal, mandarin ve altıntop türlerinden alınan bitki dokularının, moleküler yöntemle (RT-PCR) varlığı araştırılmış; TSDAV hastalığı simptomlarını göstermeyen portakal, mandarin ve altıntop türlerinden alınan bitki dokuları ile, turunç bitkisine biyolojik indeksleme yapılarak hastalığın bu türlerdeki belirtileri ortaya konmaya çalışılmış ayrıca etmenin limon ve turunç meyve kabukları ile çiçeklerinde varlığı araştırılmış; elde edilen PCR ürününün nükleotid dizilimi belirlenerek etmenin filogenetik olarak diğer virüslerle akrabalığı belirlenmeye çalışılmıştır. RT-PCR işlemi sonucunda limon, turunç, portakal, mandarin ve altıntop türlerine ait yaprak ve sürgün örneklerinin tümünde ve meyve kabuğu ile çiçek örneklerinin tümünde pozitif sonuçlar elde edilmiştir. Tohum örneklerinin tümünde negatif sonuçlar elde edilmiştir. Nükleotid dizilim analizleri ve yapılan filogenetik çalışmalar sonucunda farklı turunçgil türlerinden alınan örneklerin Pakistan, Çin Halk Cumhuriyeti ve ülkemizde daha önce limon örneklerinden yapılan etmen analizleri ile %97’nin üzerinde bir benzerlik gösterdiği belirlenmiş ayrıca farklı turunçgil türlerinin birbirileri ile olan benzerliğinin %98’in üzerinde olduğu ortaya konmuş ve etmenin Mandarivirus cinsi içinde yer aldığı belirlenmiştir. Biyolojik indeksleme çalışmaları sonucunda aşılamalarının yapıldığı tüm turunç indikatör bitkilerinde TSDAV hastalığının karakteristik simptomları gözlenmiştir.

Keywords

Turunçgil, TSDAV hastalığı, CYYCV, RT-PCR, indikatör bitki, Mandarivirus

Identification of Citrus Yellow Clearing Virus Disease Virus (CYVCV) by Molecularly on Different Citrus Species

Abstract

In this study, the Citrus yellow vein clearing virus (CYVCV) disease, first observed in Pakistan and India and then in our country is researched among the species of Citrus such as orange, mandarin and grapefruit which don’t show the characteristic symtoms of the disease. Also, the CYVCV found in the fruit and flower of lemon and sour orange is researched in this study. In the researched of the CYVCV, molecular RT-PCR method and biological indexing method to justify the obtained findings are used. As a result of the study, in all of the examples of leaves and exile belonging to the species of lemon, sour orange, orange, mandarin and grapefruit, the existence of the virus on these species are identified by obtaining a band in the length of 479 bp and 921 bp. The existance of the disease on the species of orange, mandarin and grapefruit is first determined in this study. In the studies done by rind of fruit and flower tissue the existance of the virus on these tissues is determined. In all examples of seed it is identified as molecular that the disease factor of negative result doesn’t exist in seed. As a result of the nucleotid analyses and phylogenetic studies it is identified that the examples taken from different Citrus species and analyses done previously on lemon examples showed up 97% similarly in Pakistan, China and in our country. During biological index studies, leaf deformations, pocket image of inward and outward on leaf tissues, recess in the shape of V in the edge of leaf, banding and yellow color fading on the main and edge veins of the leaf, gondol leaf, shape of wet water on the back side of the leaves are identified.

Keywords

Citrus, TSDAV disease, CYYCV, RT-PCR, indicator plant, Mandarivirus

References

• Ahlawat, Y. S. (1997) Virus, greening bacterium and viroids associated with citrus (Citrus species) decline in India. Indian J. Agric. Sci. 67:51-57.
• Catara, A., Azzaro, A., Moghal, S. M. and Khan, D. A. (1988) Virus, viroid and prokaryotic diseases of Citrus in Pakistan. Proc. 6th. Int. Citrus Congr. 3:957-963.
• Çınar, A., Kersting, U., Önelge, N., Korkmaz, S. and Şaş, G. (1993) Citrus virus and virus-like diseases in the East Mediteranean region of Turkey. In. P. Moreno, J. V. da Graça, L. W. Timer and J. A. Doods (eds.), Proc. 12th. Conf. Intern. Organization Citrus Virol. Univ. Calif. Pres, Riverside, USA.
• Korkmaz, S. (1997) Doğu Akdeniz Bölgesi turunçgillerinde vektör ile taşınan virüs benzeri bir hastalığın yayılması, taşınması, duyarlı tür ve çeşitlerin belirlenmesi ve tanılanması üzerine araştırmalar. Ç.Ü. Fen Bilimleri Enstitüsü, Doktora Tezi, Adana
• Loconsole, G., Önelge, N., Potere, O., Giampetruzzi, A., Bozan, O., Satar, S., De Stradis, A., Savino, V., Yokomi, R. K. and Saponari, M. (2013) Identification and characterization of Citrus yellow vein clearing virus, A Putative New Member of the Genus Mandarivirus. Phytopathology, 102:1168-1175.
• Murray, M. G. and Thompson, W. F. (1980) Rapid isolation of high molecular weight plant DNA. Nucleic Acids Research, 8:19.
• Önelge, N. (2003) Türkiye’de Limonlarda Sarı Damar Açılması İle İlgili İlk Rapor. J. Turk. Phytopath. 32:1, 53–55.
• Önelge, N., Bozan, O., Gök, M. and Satar, S. (2007) Yellow vein clearing of lemons in Turkey. 17th Conf. IOCV, p. 176.
• Zhao, X. Y., Chen, H. M., Li, Z. A., Wang, X. F., Zhou, Y. K., Tang, Z. C. and Zhou, Y. (2014) First report of Citrus yellow vein clearing virus on Lemon in Yunnan, China. Plant Disease, 98:12-747.
• Zhen, S., Kurth, E. G., Peremyslov, V. V., Changyong, Z., Dolja, V. V (2015) Molecular characterization of a Citrus yellow vein clearing virus strain from China. Archives of Virology, 160(7):1811-1813.