Akdeniz Bölgesi Süs Bitkisi Yetiştiricilik Alanlarında Krizantem (Chrysanthemum morifolium Ramat.) Bitkilerinde Bulunan Viroidlerin Araştırılması

Year 2021, Volume: 36 Issue: 2, 335 - 344, 31.12.2021

Gulbahar Arıkan , Saime Büşra Fidancı , Orhan Bozan , Nuket Onelge

https://doi.org/10.36846/CJAFS.2021.60

Abstract

Dünyada süs bitkilerinde virüs ve viroid etmenlerinin neden olduğu birçok hastalık bulunmaktadır. Günümüze kadar dünyada krizantemlere spesifik önemli ekonomik kayıplara neden olan 2 adet viroid cinsi tespit edilmiştir. Bunlar Avsunviroidae familyasından olan Chrysanthemum chlorotic mottle viroid (CChMVd)’i ve Pospiviroidae familyasından Chrysanthemum stunt viroid (CSVd) dir. Bu çalışmada Akdeniz Bölgesinde Adana, Mersin ve Antalya illerinden toplanan 56 krizantem örneği RT-PCR yöntemi ile taranarak 2 farklı viroidin bulaşıklığı açısından araştırılmıştır. Çalışma sonucunda krizantem bitkilerinde CSVd varlığı tespit edilmiştir. Çalışmada karantina etmeni olan CChMVd ‘i toplanan hiçbir izolatta tespit edilememiştir. CSVd etmeni mekanik olarak etrog citron ve krizantem bitkilerine aktarılmış, bu bitkiler üzerinde genel bir bodurluk yaprak küçüklüğü ve beneklenmesi belirtilerini geliştirmiştir.

Keywords

Krizantem, CSVd, CChMVd, Viroid

Supporting Institution

Çukurova Üniversitesi Bilimsel Araştırmalar Birimi (BAP) tarafından desteklenmiştir

References

• Adkar-Purushothama, C.R., Chennappa, G., Poornachandra Rao, K., Sreenivasa, M.Y., Maheshwar, P.K., Nagendra Prasad, M.N., Sano, T. 2017. Molecular diversity among viroids infecting chrysanthemum in India. Virus Genes, 53, 636–642.
• Barthe G.A., Ceccardi T.L., Manjunath K.L., Derrick K.S., 1998. Citrus psorosis virus: nucleotide sequencing of the coat protein gene and detection by hybridization and RT–PCR. Journal of General Virology, 79 (Pt 6), 1531–1537.
• Bostan, H.; Nie, X.; Singh, R.P., 2004. An RT-PCR primer pair for the detection of Pospiviroid and its application in surveying ornamental plants for viroids. J. Virol. Methods, 116, 189–193.
• Bostan, H., Gazel, M., Elibüyük, I.O., Çağlayan, K., 2010. Occurrence of pospiviroid in potato, tomato and ornamental plants in Turkey. African Journal of Biotechnology, 9: 2613-2617.
• Chung, B. N., Lim , J. H., Choi, S. Y., Kim, J. S., Lee, E. J., 2005. Occurrence of Chrysanthemum stunt viroid in Chrysanthemum in Korea. The Plant Pathology Journal, 21(4), 377-382.
• Diener, T., 1971. Potato spindle tuber ‘’virus’’ IV. A replicating low-molekular weight RNA, Virology 45, 411.
• Dimock, A.W., 1947. Chrysanthemum stunt. NY State Flower Growers Bull., 26, 2. NEW YORK STATE FLOWER GROWERS INCORPORATED, BULLETIN # 26.
• Duran-Vila, N., Pina, J.A., Ballesta, J.F., Juarez, J., Roistacher, C.N., Rivera-Bustamenta, R. And Semancik, J.S., 1988. The citrus exocortis disease: A complex of viroid-RNAs page 152-165 in:. Proc. 10 th Intern. Org. Citrus Virologist (IOCV) Conf., Riverside-California, U.S.A.
• Gobatto, D., Chaves, A.L.R., Harakava, R., Marque, J.M., Daròs, J.A., Eiras, M., 2014. Chrysanthemum stunt viroid in Brazil: Survey, identification, biological and molecular characterization and detection methods. J. Plant Pathol., 96, 111–119.
• Hosokawa, M., Ueda, E., Ohishi, K., 2004. Chrysanthemum stunt viroid disturbs the photoperiodic response for flowering of chrysanthemum plants. Planta 220, 64–70.
• Hosokawa, M., Y. Matsushita, K. Ohishi and S. Yazawa. 2005. Detection of Chrysanthemum chlorotic mottle viroid-like RNA in Japanese chrysanthemum. J. Japan. Soc. Hort. Sci. 74: 386–391.
• ICTV,2020.https://talk.ictvonline.org/taxonomy
• Kazaz, S., 2016. Dünya Süs Bitkileri Sektöründe Ürün Deseni, Sosyo Ekonomik ve Teknoloji Alanında Yaşanan Gelişmeler ile Türkiye’nin Gelecek Vizyonu. 6. Süs Bitkileri Kongresi bildiriler kitabı. Syf:3-13
• Kumar S., Stecher G., Li M., Knyaz C., and Tamura K., 2018. MEGA X: Molecular Evolutionary Genetics Analysis across Computing Platforms. Mol. Biol. Evol. 35(6):1547–1549.
• Lawson, R.H., 1987. Chrysanthemum stunt. Pages 247-259 in: The viroids. T.O. Diener, ed. Plenum Press: New York and London.
• Matteoni J.A., Allen W.R., 1989. Symptomatology of tomato spotted wilt virus infection in florist’s chrysanthemum. Canadian Journal of plant pathology.,11:373-380
• Murray M.G., Thompson W.F., 1980. Rapid isolation of high moleculer weight plant DNA. Nücleic Acids Res. Oct 10; 8 (19) 4321-4325.
• Mehle, N., Seljak, G., Verhoeven, J.Th.L., Jansen C.C.C., Prezelj, N., Ravnikar, M., 2010. Chrysanthemum stunt viroid newly reported in Slovenia. Plant Pathol., 59, 1159–1159.
• Niblett, C.L., Dickson, E., Horst, K.K., Romaine, C.P., 1980. Additional hosts and an efficient purification procedure for four viroids. Phytopathology 70, 610-615.
• Shiwak K., Iwai, T., Yamamoto, Y., 1996. Cloning and nucleotide sequence of Chrysanthemum stunt viroid. Hyogo Pre Agric Inst (Agriculture) 44:1-4.
• Titiz, S., Çakıroğlu, N., Birişçi Yıldırım, T., Çakmak, S., 2000. Süs bitkileri üretim ve ticaretindeki gelişmeler. V. Türkiye Ziraat Mühendisliği Teknik Kongresi, (17-21 Ocak 2000), Cilt II, 709-740, Ankara.
• Torchetti, E.M., Navarro, B., Trisciuzzi, V.N., Nuccitelli, L., Silletti, M.R., Di Serio, F., 2012. First report of Chrysanthemum stunt viroid in Argyranthemum frutescens in Italy. J.Plant Pathol. 94, 451-454.
• TÜİK, 2020. https://biruni.tuik.gov.tr/bitkiselapp/bitkisel.zul. (Erişim tarihi:13.09.2021)
• Verhoeven, J.T.J.; Hammond, R.W.; Stancanelli, G., 2017. Economic significance of viroids in ornamental crops. In Viroids and Satellites; Hadidi, A., Flores, R., Randles, J.W., Palukaitis, P., Eds.; Elsevier: London, UK, 27–38, ISBN 9780128014981.
• Zhao, X., Liu, X., Ge, B., 2015. A multiplex RT-PCR for simultaneous detection and identification of five viruses and two viroids infecting chrysanthemum. Arch. Virol. 160, 1145–1152.