Nematod taksonomisinde kullanılan moleküler markörler

Year 2016, , 179 - 189, 17.05.2016

Uğur Gözel , Çiğdem Yurt Çiğdem Gözel

https://doi.org/10.16969/teb.67105

Cited By: 2

Abstract

Nematodların teşhis ve tanımlamalarında morfolojik karakterler ve morfometrik ölçümler kullanılmaktadır. Bazı durumlarda klasik teşhis yöntemleri ile güvenilir sonuçlar elde etmek zor olabilmektedir. Bu nedenle nematodların doğru ve hızlı tanımlanmasında moleküler markörlerden yararlanılmaktadır. Moleküler markörler; DNA baz alınarak uygulanan yöntemlerdir. Bu makalede, nematod taksonomisinde yaygın olarak kullanılan moleküler markörlerden Restriksiyon Parça Uzunluk Polimorfizmi (RFLP), Çoğaltılmış Parça Uzunluk Polimorfizmi (AFLP), Mikrosatellitler (SSR, STR, ISSR), Rastgele Çoğaltılmış Polimorfik DNA (RADP), Tek Nükleotid Polimorfizmi (SNP) ve DNA dizi analizi (mtDNA ve rDNA) hakkında bilgi verilerek bu metodların kullanıldığı örnek çalışmalar derlenmiştir.

Keywords

DNA, moleküler markörler, teşhis, nematod

Molecular markers used in nematode taxonomy

Abstract

Morphological characters and morphometric measurements are used for diagnosis and identification of nematodes. In some cases, reliable results can not be achieved by classic methods. Therefore, molecular markers have been applied to nematode identification. Molecular markers are methods based on DNA. In this article, information regarding to the most common molecular marker techniques including Restriction Fragment Length Polymorphism (RFLP), Amplified Fragment Length Polymorphism (AFLP), Microsatellites (SSR, STR, ISSR), Random Amplified Polymorphic DNA (RADP), Single Nucleotide Polymorphism (SNP) and DNA Sequence Analysis (mtDNA and rDNA) was given and the studies done by using these methods were reviewed.

Keywords

DNA, molecular markers, diagnosis, nematode