Trakya Bölgesindeki Bal Arılarında (Apis mellifera L.) mtDNA 16S rDNA ve ND5 Genleri Analizi

Year 2017, Volume: 58 Issue: 2, 7 - 14, 23.11.2017

Raziye Işık , Fulya Özdil , Ayşe Güder

https://doi.org/10.29185/hayuretim.342734

Abstract

Bu çalışmada, Türkiye’nin Trakya bölgesinde bulunan
bal arısı populasyonlarında genetik varyasyon mitokondriyel genomda 16S rDNA ve
ND5 gen bölgeleri kullanılarak araştırılmıştır. PCR-RFLP ve DNA dizi analizi yöntemlerinden
yararlanılarak 16S rDNA ve ND5 gen bölgeleri
DraI, MboII ve SwaI restriksiyon enzimleri ile
incelenmiştir. Trakya bölgesinin Tekirdağ, Edirne, Kırklareli illeri ile Çanakkale
ve Gökçeada’nın farklı yörelerinden olmak üzere toplam 100 adet işçi arı örneği
materyal olarak kullanılmıştır. Bu çalışmada, 16S rDNA ve ND5 gen bölgelerinin DraI
ve SwaI restriksiyon enzimleri ile kesiminde iki farklı haplotip elde
edilmiştir. 16S rDNA/DraI kesimi bakımından Tip 1 haplotipinde 6 kesim
noktası tespit edilmiş ve 315, 212, 116, 116, 92, 70 ve 44 bç'lik kesim profili
elde edilmiştir. Tip 2 haplotipinde ise, C → T transizyonu sonucu 705.
pozisyonda meydana gelen nokta mutasyonu sonucu ilave bir kesim noktası daha
oluşmuş ve bu haplotipte 8 bantlık kesim profili elde edilmiştir (215, 212,
116, 116, 100, 92, 70 ve 44 bç). 16S rDNA/SwaI kesimi bakımından Tip 1
haplotipinde iki kesim noktası sonucu 359, 324 ve 282 bç’lik kesim profili tespit
edilmiş, aynı gen bölgesinin 196. nükleotidinde meydana gelen A→T
transversiyonu sonucu yeni bir kesim noktası daha oluşmuş ve 359, 324, 195 ve
87 bç’lik 4 bant veren kesim profili elde edilmiştir. Fakat bu bölgenin MboII
restriksiyon enzimi ile kesimi sonucunda tüm örneklerde 16S rDNA/MboII
bakımından tek tip haplotip belirlenmiştir. ND5 gen bölgesinde ise sadece DraI
restriksiyon enzimi ile kesim sonucunda varyasyon elde edilmiştir. ND5/DraI
kesimi bakımından Tip 1 haplotipinde 440, 270 ve 112 bç’lik kesim profili elde
edilirken, aynı gen bölgesinin 383. pozisyonda meydana gelen T→C transizyonu
sonucu DraI restriksiyon enzimi kesim noktası kaybolmuş ve 552 ve 270
bç’lik 2 banttan oluşan kesim profili elde edilmiştir. ND5 bölgesinin MboII
ve SwaI restriksiyon enzimleri ile kesiminde varyasyon bulunmamış ve tüm
örneklerde tek tip haplotip elde edilmiştir.

Keywords

Apis mellifera L., mtDNA, 16S rDNA, ND5, PCR-RFLP

References

• Bouga M, Harizanis PC, Kilias G, Alahiotis S. 2005. Genetic divergence and phylogenetic relationships of honey bee Apis mellifera (Hymenoptera: Apidae) populations from Greece and Cyprus using PCR-RFLP analysis of three mtDNA segments. Apidologie 36: 335-344.
• Hall HG. 1990. Parental analysis of ıntrogressive hybridization between African and European honeybees using nuclear DNA RFLPs. Genetics 125:611-621.
• Kandemir İ, Kence M, Sheppard WS, Kence A. 2006. Mitochondrial DNA variation in honey bee (Apis mellifera L.) populations from Turkey. Journal of Apicultural Research and Bee World 45(1): 33-38.
• Kekeçoğlu M, Bouga M, Harizanis P, Soysal MI. 2009. Genetic divergence and phylogenetic relationships of honey bee populations from Turkey using PCR-RFLP’s analysis of two mtdna segments. Bulgarian Journal of Agricultural Science 15 (6): 589-597.
• Meixner, MD, Sheppard, WS, Poklukar, J. 1993. Asymmetrical distribution of a mitochondrial DNA polymorphism between 2 introgressing honeybee subspecies. Apidologie 24: 147-153.
• Özdil, F, Aytekin, İ, İlhan, F, Boztepe, S. 2012. Genetic variation in Turkish honeybees Apis mellifera anatoliaca, A. m. caucasica, A. m. meda (Hymenoptera: Apidae) ınferred from RFLP analysis of three mtDNA regions (16S rDNA-COI-ND5). European Journal of Entomology 109 (2): 161-167.
• Palmer MR, Smith DR, Kaftanoğlu O. 2000. Turkish honeybees: genetic variation and evidence for a fourth lineage of Apis mellifera mtDNA. The Journal of Heredity 91 (1): 42-46.
• Ruttner F, Tassencourt L, Louveaux J. 1978. Biometrical statistical analysis of the geographic variability of Apis mellifera L. Apidologie 9(4): 363-381.
• Ruttner F. 1988. Biogeography and Taxonomy of Honeybees. Springer-Verlag. 193 p, Berlin.
• Sheppard WS, Arias MC, Grech A, Meixner MD. 1997. Apis mellifera ruttneri, a new honey bee subspecies from Malta. Apidologie 28 (5): 287-293.
• Smith DR, Brown WM. 1990. Restriction endonuclease cleavage site and length polymorphisms in mitochondrial DNA of Apis mellifera mellifera and A. m. carnica (Hymenoptera Apidae). Annals of the Entomological Society of America 83(1): 81-88.
• Smith DR, Slaymaker A, Palmer M, Kaftanoğlu O. 1997. Turkish honeybees belong to the East Mediterranean mitochondrial lineage. Apidologie 28 (5): 269-274.
• Ünal G and Özdil F. 2017. Genetic characterization of honey bee in Thrace region of Turkey using inter Cytochrome C oxidase subunit I and II genes. 2nd International Balkan Agriculture Congress. 16-18 May, Namık Kemal Üniversitesi, Tekirdağ, s 395.