Kocaeli’de Yayılış Gösteren Bazı Böcek Türlerinin Mitokondrial Sitokrom Oksidaz Alt Ünite 1 Geni ile Filogenetik Analizi

Year 2018, Volume: 1 Issue: 2, 62 - 66, 29.12.2018

Fikriye Polat , Serkan Dede Günsel Bingöl , Aysel Kekillioğlu

Abstract

Böcek
türleri bakımından zengin bir coğrafyada yaşamaktayız. Ancak coğrafyamızda
tespit edilen böcek türleri sayısı tahmin edilen sayıdan çok daha azdır.
Buradan yola çıkarak yapılan bu çalışmada, Kocaeli ilinden rastgele toplanılan
çeşitli böcek türlerinin moleküler düzeyde tespit edilmesi amaçlandı. Bunun
için böceklerden önce DNA izolasyonu ardından mitokondrial COI bölgelerine ait
evrensel primerler kullanılarak Polimeraz Zincir Reaksiyonu (PZR) ve DNA sekans
analizi yapıldı. Her bir DNA dizisi NCBI Nucleotide BLAST’a yüklenerek erişim
numaraları elde edildi. Böcek türlerine ait COI gen dizileri MEGA 7.0
programına yüklenerek modelleme yöntemleri ve mesafeleri belirlendi.  DNA barkod geni olarak yaygın bir şekilde
kullanılan COI geni ile yapılan bu çalışmada, böcek türlerinin Exechia seriata, Phlebotomus neglectus, Chironomus
riparius, Drosophila tsukubaensis,
ve Rhamphomyia sp. oldukları tespit
edildi.

Keywords

Böcek, COI geni, Filogenetik Analiz, Kocaeli

References

• Hancı H., 2003. Adli Entomoloji, TBB Dergisi, 2003(49).
• Aydın G., 2016. Böceklerin Sınıflandırılması (Takım) Düzeyinde,http://atabeymyo.isparta.edu.tr/assets/uploads/sites/76/files/boceklerin-siniflandirilmasi-1810201 6.pdf.
• Gullan P. J., Cranston P. S., 2005. The Insects: An Outline of Entomology, 4. ed., Blackwell Publishig, California, USA.
• Hancı İ., Tüzün A., Açıkgöz N., Balseven A., Candar, S., 2002. Adli Entomoloji, Asayiş Daire Başkanlığı, Yayın no: 9, Ankara.
• Eric J., Biyoloji Öz., 2015. 1. Baskı, Pearson, Nobel, Ankara.
• Yılmaz C., 2017. Terme’nin Biyoçeşitlilik ve Doğal Ortam Özellikleri, O.M.Ü. Eğitim Fak. Serander Yayınları, Samsun.
• Yıldırım E., 2012. The distribution and biogeography of Vespidae (Hymenoptera: Aculeata) in Turkey, Türk Entomol. Dergisi., 36(1), 23-42.
• Yıldırım E., Gusenleitner J., 2012. Contribution to the knowledge of the Vespidae (Hymenoptera, Aculeata) of Turkey, with a checklist of the Turkish species, Türk J. Zool., 36(3), 361-374.
• https://en.wikipedia.org/wiki/Rhamphomyia (Erişim tarihi: 29.08.2018).
• Ivović V., Chaniotis V., Vujanić M., B. Bobić B., Nikolić A., Klun A., Živković T, Djurković-Djaković O., 2010., Life Tables And Reproductive Parameters Of Phlebotomus Neglectus Tonnoır, 1921 (Diptera, Psychodidae) Under Laboratory Conditions. Arch. Biol. Sci., Belgrade, 62(1), 153-157.
• Chaniotis B., Spyridaki I., Scoulika E., Antoniou M., 2000. Colonization of Phlebotomus neglectus (Diptera: Psychodidae), the major vector of visceral leishmaniasis in Greece. J Med Entomol., 37(3): 346-348.
• https://en.wikipedia.org/wiki/Chironomus_riparius, Erişim tarihi 29.08.2018.
• Barták M., Danielson R., 2007. Revision of Rhamphomyia species (Diptera, Empididae) described by J. W. Zetterstedt. Acta Zoologica Universitatis Comenianae 47(2): 105–114.
• https://en.wikipedia.org/wiki/Drosophila, (Erişim Tarihi 29.08.2018).
• Hebert P. D. N., Cywinska A., Ball S. L., deWaard J. R., 2003a. Biological identifications through DNA barcodes. Proceedings Of The Royal Society B: Biological Sciences. 270, 313-321.
• Avise J. C., 2000. Phylogeography: the history and formation of species. Harvard university pres, Harvard.
• Hebert P. D. N., Ratnasingham S., deWaard J. R., 2003b. Barcoding animal life: cytochrome c oxidase subunit 1 divergences among closely related species. Proceedings in Biological Sciences, 270(1): 96–99.
• Arnot D. E., Roper C., Bayoumi R. A., 1993. Digital codes from hypervariable tandemly repeated DNA sequences in the Plasmodium falciparum circumsporozoite gene can genetically barcode isolates. Molecular and Biochemical Parasitology, 61, 15-24.
• Ball S. L., Armstrong K. F., 2006. DNA barcodes for insect pest identification: a test case with tussock moths (Lepidoptera: Lymantriidae). Canadian Journal of Forest Research, 36(2), 337-350.
• Martijn J. T. N., Timmermans C. V., Geoff M., Kevin H. A., Vogler P., 2016. Rapid assembly of taxonomically validated mitochondrial genomes from historical insect collections. Biological Journal of the Linnean Society, 117, 83-95.