Suda Toxoplasma gondii Analizi ve Yeni Bir Yaklaşım: İlmiğe Dayalı İzotermal Amplifikasyon Tekniği

Yıl 2018, Cilt: 1 Sayı: 1, 30 - 37, 29.06.2018

Banuçiçek Yücesan Özcan Özkan

Öz

Toxoplasma
gondii, tüm dünyada yaygın olarak görülen ve bütün
omurgalıları tutabilen, zorunlu hücre içi bir protozoondur. Dünya nüfusunun
yaklaşık en az üçte birinde bu etkene karşı gelişen antikorların varlığı tespit
edilmiştir. Ülkemizde genel popülasyondaki ortalama T. gondii seroprevalansı
%40 oranındadır. Etken çoğunlukla, doku kistleri ile enfekte pişmemiş etlerin
tüketilmesi veya enfekte kedilerin dışkılarındaki ookistler ile kontamine az
pişmiş yiyecek veya kontamine suyun tüketimi ile enfeksiyona neden olmaktadır.
İnsanlarda ookist kaynaklı enfeksiyonların doku kisti kaynaklı enfeksiyonlardan
daha ciddi seyrettiği belirlenmiştir. Buna karşılık, yakın geçmişe kadar T. gondii’nin sular vasıtasıyla
iletiminin nadir olduğu kabul edilmiştir. Ancak, dünyada T. gondii ile oluşan salgınlar suyun tekrar gündeme gelmesini
sağlamıştır. Bu nedenle, toxoplasmosis için gerekli önlemlerin alınması
noktasında su analizleri de önemli bir konum edinmiş durumdadır. Suda T. gondii analizi daha çok moleküler
yöntemlerle, özellikle Polimeraz Zincir Reaksiyonu (PZR) ve ilmiğe dayalı
izotermal amplifikasyon (Loopmediated isothermal amplification; LAMP) ile yapılmaktadır.
Bu derlemede toksoplasmosis bulaşında bugüne kadar ihmal edilen suyun önemi,
yapılması gerekenler ve ilgili moleküler teknikler üzerinde durulmuştur.

Anahtar Kelimeler

İlmiğe Dayalı İzotermal Amplifikasyon, Su, Toxoplasma gondii

Toxoplasma gondii Analysis in Water and A New Approach: Loopmediated İsothermal Amplification Technique

Öz

Toxoplasma
gondii is an
obligate intracellular protozoan parasite. It is one of the most common disease
seen worldwide and can affect all the vertebrates. Toxoplasmosis is a disease
caused by T. gondii and least
one-third of the world’s population has detectable T. gondii antibodies. Seroprevalence of the disease is
approximately 40% in Turkish population. Humans become infected with T. gondii mainly by ingesting uncooked
meat containing viable tissue cysts or by ingesting food or water contaminated
with oocysts from the feces of infected cats. Circumstantial evidence suggests
that oocyst-induced infections in humans are clinically more severe than tissue
cyst-acquired infections. Until recently, waterborne transmission of T. gondii was considered uncommon. But
the epidemics of toxoplasmosis made the topic became an agenda of the World
again. That's why it is a must to take the necessary precautions and analyses
should be done for the disease which is epidemic throughout water. Nowadays
water analysis for the agent is mostly conducted with molecular studies,
especially Polymerase Chain Reaction (PCR) and Loopmediated isothermal amplification (LAMP). This review puts emphasis on the importance of disregcharded Toxoplasma which can be plagued
throughout water and also will highlight the necessary precautions that should
be taken.

Anahtar Kelimeler

Toxoplasma gondii, Water, Loopmediated isothermal amplification

Kaynakça

• 1- Akçay, S, Pamukçu M, Baran S, (1950). First observation of toxoplasmosis in dogs (in Turkey).Türk Veteriner Hekimleri Derneği Dergisi 20, 245-254. 2- Altıntaş N, (2008). Parasitic zoonotic diseases in Turkey. Vet Ital 44 (4), 633-646. 3- Baldursson S, Karanis P, (2011). Waterborne transmission of protozoan parasites: review of worldwide outbreaks - an update 2004-2010. Water Res 45 (20), 6603-14. Doı: 10.1016/j.watres.2011.10.013. 4- Benenson MW, Takafuji ET, Lemon SM, Greenup RL, Sulzer AJ, (1982). Oocyst-transmitted toxoplasmosis associated with ingestion of contaminated water. N Engl J Med. 307 (11), 666-9. DOI: 10.1056/NEJM198209093071107. 5- Bowie WR, King AS, Werker DH, Isaac-Renton JL, Bell A, Eng SB,et al, (1997). Outbreak of toxoplasmosis associated with municipal drinking water. The BC Toxoplasma Investigation Team. Lancet 350(9072), 173-7. 6- Bişkin Z, Yıldırım A, İnci A, Düzlü Ö, (2011). Parazitolojide teşhis amaçlı kullanılan moleküler biyolojik teknikler. Erciyes Üniv. Vet Fak Der 8(1), 43-51. 7- CDC (Center for Disease Control and Prevention) Toxoplasmosis. 2016. http://www.cdc.gov/parasites/toxoplasmosis/biology.html. Erişim tarihi: 27.03.2016 8- Çavuşoğlu C, (2016). Erişim adresi: http://www.ankaramikrobiyoloji.org.tr/docs/8kongre/Cengiz_Cavusoglu.pdf. Erişim tarihi:23.11.2016. 9- Demirel E, Kolören Z, Karaman Ü, Ayaz E, (2014). Giresun’da su örneklerinde Toxoplasma gondii’nin polimeraz zincir reaksiyonu ve ilmiğe dayalı izotermal amplifikasyon yöntemiyle araştırılması. Mikrobiyol Bul 48(4):661-668. 10- Dubey JP,(2008). The History of Toxoplasma gondii—The First 100 Years. J. Eukaryot. Microbiol 55(6), 467–475. DOİ: 10.1111/j.1550-7408.2008.00345.x. 11- Dubey JP, Lindsay SD, Speer CA, (1998). Structures of T.gondii Tachyzoites, Bradyzoites, and Sporozoites and Biology and Development of Tissue Cysts. Clinical Microbiology Reviews 11(2), 267-299. 12- Dumètre A, Dardé ML, (2007). Detection of Toxoplasma gondii in water by an immunomagnetic separation method targeting the sporocysts. Parasitol Res101(4), 989-96. DOI: 10.1007/s00436-007-0573-0. 13- Durdu B, (2008). Sağlıklı gebelerde Toxoplasma IgG avidite değerlerinin incelenmesi ve seropozitifliğe etki eden çeşitli faktörlerin araştırılması. Uzmanlık tezi. TC. Sağlık Bakanlığı Haseki Eğitim ve Araştırma Hastanesi Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Kliniği. İstanbul. 14- Gasser RB, (2006). Molecular tools—advances, opportunities and prospects. Vet Parasitol 136(2), 69-89. DOI: 10.1016/jvetpar.2005.12.002. 15- 10.İnci M, Yağmur G, Aksebzeci T, Kaya E, Yazar S, (2009). Kayseri’de kadınlarda Toxoplasma gondii seropozitifliğinin araştırılması. Türkiye Parazitol Derg 33 (3), 191 – 194. 16- Jones JL, Dubey JP, (2010). Waterborne toxoplasmosis--recent developments. Exp Parasitol 124(1), 10-25. DOI: 10.1016/j.exppara.2009.03.013. 17- Keenihan SH, Schetters T, Taverne J, (2002). In brief. Trends in Parasitology 18(5), 203-204. 18- Koloren Z, Avşar C, Şekeroğlu ZA, (2010). Protozoonların tanısında ilmiğe dayalı izotermal çoğaltma yöntemi. Türkiye Parazitol Derg 34, 207-11. DOI: 10.5152/tpd.2010.16. 19- Koloren Z, Demirel E, (2013). Detection of Toxoplasma gondiiin Turkish river and drinking water samples by different PCR and LAMP Methods. Clean Soil Air Water 41(10), 963-8.DOI: 10.1002/clen.201200468. 20- Koloren Z, Demirel E, (2013). Investigation on Toxoplasma gondiiin surface and drinking water samples from Amasya by nested polymerase chain reaction. Journal of Applied Biological Sciences 7(2), 10-3. 21- Kourenti, C, Karanis P, (2004). Development of a sensitive polymerase chain reaction method for the detection of Toxoplasma gondii in water. Water Sci Technol 50, 287–29. 22- Kourenti C, Karanis P, (2006). Evaluation and applicability of a purification method coupled with nested PCR for the detection of Toxoplasmaoocysts in water. Lett Appl Microbiol 43(5), 475-81. DOI: 10.1111/j.1472-765X.2006.02008.x. 23- Mahmoudi MR, Kazemi B, Haghighi A, Karanis P, (2015). Detection of Acanthamoeba and Toxoplasma in river water samples by moleculer methods in İran. Iran J Parasitol 10(2), 250-257. 24- Meireles LG, Ekman CCJ, Andrade HF, Luna EJA, (2015). Human toxoplasmosis outbreaks and the agent infecting form. Findings from a systematic review. Rev. Inst.Med. Trop. Sao. Paulo. 57(5):369-376. DOI: 10.1590/S0036-46652015000500001. 25- Montoya JG, Liesenfeld O, (2004). Toxoplasmosis. Lancet 363, 1965–1976. DOİ: 10.1086/338827. 26- Notomi T, Okayama H, Masubuchi H, Yonekawa T, Watanabe K, Amino N, (2000). Loop-mediated iso thermal amplification of DNA. Nucleic Acids Res 28, 63E. 27- Özcel M, (2007). Toxoplasmosis. 141-189. In: Özcel MA, Özbel Y, Ak M.(Eds) Özcel’in Tıbbi Parazit Hastalıkları. 1. Baskı. Türkiye Parazitoloji Derneği Yayınları, İzmir. 28- Paris DH, Blacksell SD, Newton PN, Day NP, (2008). Simple, rapid and sensitive detection of Orientia tsutsugamushi by loop-isothermal DNA amplification. Trans R Soc Trop Med Hyg 102(12), 1239-46. DOI: 10.1016/j.trstmh.2008.04.040. 29- Pappas G, Roussos N, Falagas ME, (2009). Toxoplasmosis snapshots: Global status of Toxoplasma gondii seroprevalence an implications for pregnancy and congenital toxoplasmosis. Int. J. Parasitol 39, 1385–1394. DOİ: 10.1016/jiipara 2009.04.003. 30- Palanisammy M, Phill M, Madhavan B, Balasundaram MB, Andavar R, Venkatapathy N, (2006). Outbreak of oculer toxoplasmosis in Coimbatore,İndia. İndian J Ophthalmol 54, 129-131. 31- Sroka J, Wójcik-Fatla A, Dutkiewicz J, (2006). Occurrence of Toxoplasma gondii in water from wells located on farms. Ann Agric Environ Med 13(1), 169-75. 32- Sotiriadou I, Karanis P, (2008). Evaluation of loop-mediated isothermal amplification for detection of Toxoplasma gondii in water samples and comparative findings by polymerase chain reaction and immunofluorescence test (IFT). Diagn Microbiol Infect Dis 62(4), 357-65. DOI: 10.1016/j.diagmicrobio.2008.07.009. 33- Tlamçani Z, Lemkhenete Z, Lmimouni BE, (2013). Toxoplasmosis: thevalue of moleculermethods in diagnosis compared to conventional methods. JMID 3 (2), 93-99. DOİ: 10.1016/j.cimid.2012.10.006. 34- Unat EK, Yücel A, Atlaş K, Samasti M, (1991). Unat’ın Tıp Parazitolojisi. Cerrahpaşa Tıp Fakültesi yayınları, İstanbul. 601-622. 35- Vanwormer E, Fritz H, Sharipo K, Mazet JAK, Conrad PA, (2013). Molecule stomodelling: Toxoplasma gondii oocysts at the human animal environment interface. Comp Immunol Microbio Infect Dis 36(3), 217- 231. DOİ: 10.5799/ahinjs.02.2013.02.0089 36- illena I, Aubert D, Gomis P, Ferte H, Inglard JC, Bisiaux HD, et al, (2004). Evalution of a strategy for Toxoplasma gondii oocyst detection in water. Applied and Eniıronmental microbiology 70 (7), 4035-4039. DOİ: 10.1128/AEM 70.7.4035-4039.2004. 37- Yang W, Lindquist HDA, Cama V, Schaefer FW, Villegas E, Fayer R, et al,(2009). Detection of Toxoplasma gondii Oocysts in Water Sample Concentrates by Real-Time PCR. Appl. Environ. Microbiol 75(11), 3477-3483. DOI: 10.1128/AEM.00285-09. 38- Zhang H, Thekisoe OM, Aboge GO, Kyan H, Yamagishi J, Inoue N, et al, (2009). Toxoplasma gondii: sensitive and rapid detection of infection by loop-mediated isothermal amplification (LAMP) method. Exp Parasitol 122(1), 47-50. DOI: 10.1016/j.exppara.2009.01.012.