Adana ve İçel İllerinde Elma Bahçelerinde Elma Çoklu Sürgün Fitoplazma Hastalığı (Candidatus Phytoplasma mali)’ nın Varlığının Belirlenmesi

Yıl 2019, Cilt: 24 Sayı: 1, 15 - 20, 24.05.2019

Şefika Yavuz , Mona Gazel , Kadriye Çağlayan

Öz

Amaç: Bu çalışmada Adana ve İçel illerinde Elma çoklu sürgün fitoplazması (Candidatus Pyhtoplasma mali) nın varlığı araştırılmıştır.

Yöntem ve Bulgular: Adana ve İçel illerinde elma yetiştirilen alanlarda 2013-2016 yılları arasında yapılan arazi çalışmaları sırasında fitoplazma hastalıkları açısından 39 bahçe ve 234 ağaç incelenmiştir. Örneklerin DNA izolasyonları, PCR (Polimeraz Zincir Reaksiyonu) ve RFLP (Restriksiyon Fragment Uzunluklu Polimorfizm) analizleri yapılmıştır. Sonuçlara göre PCR/RFLP analizleriyle testlenen 234 örnekten 14 tanesi “Candidatus Pyhtoplasma mali” pozitif kontrolü ile aynı büyüklükte amplifikasyon oluşturmuştur.

Genel Yorum: Elma (Malus domestica Borkh.), ülkemizde uzun yıllardır yetiştirilen, yumuşak çekirdekliler arasında yer alan, önemli üretim alanına sahip ılıman iklim meyvelerindendir. EÇSF ülkemiz karantina listesinde yer alan ve dünyada elma üretimini ekonomik ölçüde sınırlandıran bir hastalıktır. Bu nedenle hastalığın elma yetiştiriciliği yapılan alanlardaki durumu önem arz etmektedir.

Çalışmanın Önemi ve Etkisi: Bu çalışma Adana ve İçel illerinde EÇSF’nin varlığının tespitine yönelik yapılan bir araştırma olup özellikle İçel ilinde enfeksiyon varlığının ortaya konduğu bir çalışma olmuştur.

Anahtar Kelimeler

Fitoplazma, Elma çoklu sürgün fitoplazması, Canditatus Phytoplasma mali, Elma

Determination of apple proliferation phytoplasma disease (Candidatus Phytoplasma mali) in apple orchards in Adana and İçel provinces

Öz

Aims: In this study, the presence of Apple Proliferation (Candidatus Pyhtoplasma mali) was investigated in Adana and İçel provinces.

Methods and Results: Surveys were conducted in apple growing areas of Adana and İçel provinces between 2013-2016 and 234 trees in 39 different orchards were investigated for phytoplasma diseases. DNA isolations of samples, PCR and RFLP (Restriction Fragment Length Polymorphism) analysis were performed. Amplicated fragments of 14 out of 234 samples tested by PCR/RFLP analysis observed as same as “Candidatus Pyhtoplasma mali” positive control.

Conclusions: Apple (Malus domestica Borkh.) is among the temperate pome fruits that has been important production areas, and grown for many years in our country. AP is listed in quarantine in our country and economically limits apple production in the world. So that, the condition of the disease is important in the apple growing areas.

Significance and Impact of the Study: This study was conducted to determine the presence of AP in Adana and İçel provinces, and especially was to reveal the presence of phytoplasma infection in İçel.

Anahtar Kelimeler

Phytoplasma, apple proliferation phytoplasma, Canditatus Phytoplasma mali, apple

Kaynakça

• Altan B, Öztürk Y, Ünlü M, Gür H, Faruk S, Serçe ÇU, 2016. 16Sr-X Grubuna giren Bazı Fitoplazma Etmenlerinin Moleküler Analizlerinde En Uygun Koşullarının Belirlenmesi. Uluslararası Katılımlı Türkiye VI. Bitki Koruma Kongresi, 5-8 Eylül, Konya, s 538.
• Anonim, 2011. European and Mediterranean Plant Protection Organization, https://www.eppo.int/
• Anonim, 2017a. Türkiye İstatistik Kurumu, www.tuik.gov.tr
• Anonim, 2017b. European and Mediterranean Plant Protection Organization, https://www.eppo.int/
• Bora T, Karaca İ, 1970. Kültür Bitkilerinde Hastalığın ve Zararın Ölçülmesi, Ege Üniversitesi Ziraat Fakültesi, Yardımcı Ders Kitabı No:167, Bornova.
• Canik D, Ertunc F, 2007. Distribution and molecular characterization of apple proliferation phytoplasma in Turkey. Bullettin of Insectology, 60 (2): 335-336.
• Çağlayan K, Gazel M, Serçe ÇU, Kaya K, 2014. Türkiye’de Bazı Meyve Ağaçlarında Saptanan Fitoplazmalar ve Olası Vektörleri. Türkiye V. Bitki Koruma Kongresi, 3-5 Şubat, Antalya, s 190.
• Dağtekin Ş, 2009. Akdeniz Bölgesindeki iki elma koleksiyon parselinde Elma Çoklu Sürgün Fitoplazması hastalığının (Candidatus Phytoplasma mali) moleküler yöntemlerle tanılanması. Yüksek Lisans Tezi, Mustafa Kemal Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü, Hatay, 25 s.
• Deng S, Huriki C, 1991. Amplification of 16S rRNA genes from culturable nad nonculturable Mollicutes. Journal of Microbiological Methods, 14 (1): 53-61.
• Doyle JJ, Doyle JL, 1990. Isolation of plant DNA from fresh tissue. Focus, 12: 13–15.
• Lee IM, Davis RE, Chen TA, Chiykowski LN, Fletcher J, Hiruki C, Schaff DA, 1992. A genotype-based system for identification and classification of mycoplasmalike organisms (MLOs) in the aster yellows MLO strain cluster. Phytopathology, 82: 977-986.
• Lee IM, Gundersen DE, Davis RE, Bartoszyk IM, 1998. Revised classification scheme of phytoplasmas based on RFLP analyses of 16S rRNA and ribosomal protein gene sequences. Plant Pathology, 56: 721.
• Lorenz KH, Schneider B, Ahrens U, Seemüller E, 1995. Detection of the apple proliferation and pear decline phytoplasmas by PCR amplification of ribosomal and nonribosomal DNA. Phytopathology, 85: 771-776.
• Martini M, Musetti R, Grisan S, Polizzotto R, Borselli, S., Pavan, F. and Osler, R. (2009) DNA-dependent detection of the grapevine fungal endophytes Aureobasidium pullulans and Epicoccum nigrum. Plant Disease, 93: 993–998.
• Öztürk Y, Altan B, İşçi M, Kaymak S, Serçe ÇU, Erdoğan ŞR, Şenyurt H, Aydınlı M, 2016. Elma ve Armut Yetiştirilen Bazı Bölgelerde Apple Proliferation Grubu (16SrX) Fitoplazmaların Araştırılması. Uluslararası Katılımlı Türkiye VI. Bitki Koruma Kongresi, 5-8 Eylül, Konya, s 670.
• Rui D, Ciferri R, Refatti E, 1950. La virosi degli "scopazzi del melo" nel Veronese. Notiziario delle Malattie delle Piante, 13: 7-11.
• Seemuller E, Schneider B, 2004. ‘Candidatus Phytoplasma mali’, ‘Candidatus Phytoplasma pyri’ and ‘Candidatus Phytoplasma prunorum’, the casual agents of Apple Proliferation, Pear Decline and European Stone Fruit Yellows, respectively. International Journal of Systematic Bacteriology and Evolutionary Microbiology, 54: 1217-1226.
• Seemüller E, Garnier M, Schneider B, 2002. Mycoplasmas of plants and insects. In: Molecular Biology and Pathology of Mycoplasmas (Razin S, Herrmann R, Eds). Kluwer Academic / Plenum Publishers, London, UK, 91-116 pp.
• Sertkaya G, Martini M, Osler R, 2008. First report of Candidatus Phtoplasma mali in Turkey. Journal of Plant Pathology, 90(1):143-149.
• Smart CD, Schneider B, Blomquist CL, Guerra LJ, Harrison NA, Ahrens U, Lorenz KH, Seemüller E, Kirkpatrick BC, 1996. Phytoplasma-specific PCR primers based on sequences of the 16S-23S rRNA spacer region. Applied and Environmental Microbiology, 62: 2988–2993.