Determination of Variation Between Some Alfalfa (Medicago sativa L.) Genotypes by Principal Component and Clustering Analysis

Yıl 2018, Cilt: 5 Sayı: 3, 222 - 228, 31.10.2018

Mehmet Öten , Sebahattin Albayrak

https://doi.org/10.19159/tutad.421625

Cited By: 1

Öz

The aim
of this study is to evaluate 26 alfalfa population in terms of 21 characters
and to determine morphology of kinship degrees by using NTSYS 2.1 statistical software based correlation matrix and unweigted
pair group method arithmetic average (UPGMA). The study carried in
trial area of Batı Akdeniz Agricultural Research Institute in 2013-2014. As a
result of the clustering analysis; correlation coefficients among pairs ranged
from 50% to 98%. The average similarity coefficient of the genotypes was r=
0.50 and five subgroup were detected under the two main groups. Six basic
component axes were obtained that defining 84.33% of the total variation of
genotypes.

Anahtar Kelimeler

Alfalfa, cluster, principal component, relationship

Bazı Yonca (Medicago sativa L.) Genotipleri Arasındaki Varyasyonun Kümeleme ve Temel Bileşen Analizi Metodu ile Belirlenmesi

Öz

Bu
çalışmanın amacı; yonca ileri ıslah programlarında kullanılmak üzere, 26 adet
yonca populasyonunu, 21 özellik açısından değerlendirip, morfolojik olarak
akrabalık dereceleri NTSYS 2.1 paket programı kullanılarak korelasyon matriksi
ile kümeleme/tartısız aritmetik grup ortalamaları (UPGMA) metotlarına göre
belirlenmesidir. Araştırmada tarla denemesi 2013 ve 2014 yıllarında Batı
Akdeniz Tarımsal Araştırma Enstitüsü Müdürlüğü deneme alanında yürütülmüştür. Yapılan
kümeleme analizi sonucunda; hatlar % 50 ile % 98 arasında benzerlik
göstermiştir. Genotiplerin ortalama benzerlik katsayısı r= 0.50 olup, buna
göre genotipler 2 ana grup altında 5 alt gruba ayrılmıştır. Temel bileşen
analizi sonucu ise genotiplere ait toplam varyasyonun % 84.33’ünü
tanımlayan 6 adet temel bileşen ekseni elde edilmiştir.

Anahtar Kelimeler

Yonca, kümeleme, temel bileşen, akrabalık derecesi

Kaynakça

• Albayrak, S., Türk, M., Sevimay, C.S., Kazaz, S., Tong, M., 2014. Göller yöresinde adi yonca (Medicago sativa L.) populasyonlarının toplanması ve karakterizasyon çalışmaları. Sonuç Raporu, TUBİTAK, Proje No: 110O257, 74s.
• Altınok, S., Türk., M, Erol, T., 2011. Ankara ili doğal vejetasyonunda bulunan yabani yonca (Medicago sativa L.) populasyonlarının toplanması ve karakterizasyon çalışmaları ile mera tipi yonca hatlarının belirlenmesi. Sonuç Raporu, TUBİTAK, Proje No: 108O634, 115s.
• Annicchiarico, P., 2006. Diversity, genetic structure, distinctness and agronomic value of Italian lucerne (Medicago sativa L.) landraces. Euphytica, 148(3): 269-282.
• Anonim, 2014. T.C. Gıda Tarım ve Hayvancılık Bakanlığı, Tarım İşletmeleri Genel Müdürlüğü Boztepe Tarım İşletmesi Müdürlüğü, Meteoroloji İstasyonu Verileri, Antalya.
• Anonymous, 2012. United States Department of Agriculture (USDA), Agricultural Research Service, National Plant Germplasm System, (http://www.ars-grin.gov/npgs/descriptors/alfalfa), (Erişim tarihi: 13.07.2012).
• Aygün, C., Çakal, Ş., Kara, A., 2009. Characterization of some coksfoot (Dactylis glomerata L.) lines from the natural rangelands of Eastern Anatolia. Biological Diversity and Conservation, 2(2): 57-64.
• Balkaya, A., Yanmaz, R., Kar, H., Apaydın, A., 2005. Morphological characterisation of white head cabbage (Brassica oleraceae var. capitata subvar. alba) genotypes in Turkey. New Zeland Journal of Crop and Horticultural Science, 33(4): 1-9.
• Benabderrahim, M.A., Mansour, H., Ali, F., 2009. Diversity of lucerne (Medicago sativa L.) populations in south Tunisia. Pakistan Journal of Botany, 41(6): 2851-2861.
• Bilmez, A., Söğüt, T., 2015. Türkiye’nin farklı bölgelerinden sağlanan susam (Sesamum indicum L.) populasyonlarının agro-morfolojik özellikler bakımından karşılaştırılması. 11. Tarla Bitkileri Kongresi, 7-10 Eylül, Çanakkale, s. 240-241.
• Dias, P.M.B., Julier, B., Sampoux, J.P., Barre, P., Dall’Agnol, M., 2007. Genetic diversity in red clover (Trifolium pratense L.) revealed by morphological and microsatellite (SSR) markers. Euphytica, 160(2): 189-205.
• Ferriol, M., Picó, B., Nuez, F., 2003. Genetic diversity of a germplasm collection of Cucurbita pepo using SRAP and AFLP markers. Heoretical and Applied Genetics, 107: 271-282.
• Gözen, V., 2008. Hıyarda (Cucumis sativus L.) örtü altı yetiştiriciliğine uygun hibrit çeşit ıslahında morfolojik karakterizasyon, hibrit kombinasyonları ile hibrit tohum verim ve kalitesinin belirlenmesi. Doktora tezi, Ankara Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü, Ankara.
• Hair, J.R., Anderson, R.E., Tatham, R.L., Black, W.C., 1995. Multivariate Data Analysis with Readings. 4th Edition, Prentice-Hall, Englewood Cliffs (NJ).
• Jenczewski, E., Prosperi, J.M., Ronfort, J., 1999. Evidence for gene flow between wild and cultivated medicago sativa (Leguminosae) based on allozyme markers and quantitative traits. American Journal of Botany, 86(5): 677-687.
• Karaağaç, O., 2006. Bafra kırmızı biber (Capsicum annuum var. conoides Mill.) gen kaynaklarının karakterizasyonu ve değerlendirilmesi. Yüksek lisans tezi, Ondokuz Mayıs Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü, Samsun.
• Karaköy, K., 2001. Çukurova koşullarında yonca (Medicago sativa L.) ile farklı oranlardaki domuz ayrığı (Dactylis glomerata L.) ve kılçıksız brom (Bromus inermis L.) karışımlarının ot verimi ve verimle ilgili özelliklere etkisi üzerinde bir araştırma. Yüksek lisans tezi, Çukurova Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü, Adana.
• Mohammadi, S.A., Prasanna, B.M., 2003. Analysis of genetic diversity in crop plants salient statistical tools and considerations. Crop Science, 43(4): 1235-1248.
• Öten, M., Çeçen, S., Erdurmuş, C., 2017. Antalya doğal florasından toplanan bazı mürdümük (Lathyrus sativus L.) hatlarının verim özelliklerinin belirlenmesi. Ege Üniversitesi Ziraat Fakültesi Dergisi, 54(1): 17-26.
• Özdamar, K., 2004. Paket Programlar ile İstatiksel Veri Analizi (Çok Değişkenli Analizler). 5. Baskı, Kaan Kitapevi.
• Prosperi, J.M., Jenczewski, E., Angevain, M., Ronfort, J., 2006. Morhological and agronomic diversity of wild genetic resources of Medicago sativa L. collected in Spain. Genetic Resources and Crop Evaluation, 53(4): 843-856.
• Rohlf, F.J., 2005. NTSYS-pc: Numerical Taxonomy and Multivarite Analysis System. Version 2.2, User Guide, Exeter Software, New York.
• Sardana, S., Mahajan, R.K., Gautam, N.K., Ram, B., 2007. Genetic variability in pea (Pisum sativum L.) germplasm for utilization. SABRAO Journal of Breeding and Genetics, 39(1): 31-41.
• Sneath, P.H.A., Sokal, R.R., 1973. Numerical Taxonomy. W.H. Freman Co., San Francisco, USA.
• Tan, Ş., 2005. Bitki Islahında İstatistik ve Genetik Metotlar. Ege Tarımsal Araştırma Enstitüsü Müdürlüğü Yayın No: 121, Menemen/İzmir, s.129-145.
• Tucak, M., Popović, S., Čupić, T., Šimić, G., Gantner, R., Meglič, V., 2009. Evaluation of alfalfa germplasm collection by multivariate analysis based on phenotypic traits. Romanian Agricultural Research, 26: 47-52.