Marmara Bölgesinde Zeytin Dal Kanseri Hastalığının Yaygınlığı ve Pseudomonas savastanoi pv. savastanoi İzolatlarının Fenotipik ve Genotipik Karakterizasyonu

Year 2011, Volume: 17 Issue: 4, 0 - , 04.12.2011

Mustafa Mirik

Abstract

Özet

Marmara Bölgesinde Tekirdağ, Çanakkale, Balıkesir, Bursa ve Yalova illerindeki zeytin üretim alanlarında survey yapılarak, Pseudomonas savastanoi pv. savastanoi’nin neden olduğu dal kanseri hastalığının yaygınlığı araştırılmıştır. Hastalığın yaygınlık oranı Çanakkale’de %100, Balıkesir’de %81, Tekirdağ’da %66, Bursa’da %4 oranlarında saptanırken, Yalova’da hastalığa rastlanılmamıştır. Hastalığın bahçe içindeki bulunuş oranının Çanakkale’de %73, Balıkesir’de %56, Tekirdağ’da %30 ve Bursa’da %0.6 olduğu tespit edilmiştir. Marmara Bölgesinden toplanan 104 hasta bitki örneğinden King B ve PVF1 besi yerlerine yapılan izolasyonlarda, tütünde aşırı duyarlılık reaksiyonu pozitif olan 208 bakteri izolatı elde edilmiştir. Bunların içerisinden seçilen 38 bölge izolatı ve bir referans izolat (CFPB 1672) ile yapılan patojenite testlerinde bu izolatların tümünün Edremit çeşidi zeytin fidanlarında patojen olduğu saptanmıştır. Patojenite testi sonucu 88 adet re-izolat elde edilmiş ve tanı testlerinde kullanılmıştır. İzolatların tamamı gram negatif, oksidaz negatif, patates dilimlerinde pektolitik aktivite negatif, SNA besi yerinde levan olmayan tipte koloniler üretmişlerdir. Arginin dehidrolaz aktivitesinin negatif ve tütünde aşırı duyarlılık reaksiyonu pozitif olarak belirlenmiştir. Tanı sonuçları, BIOLOG, spesifik PCR ve yağ asit analizlerine dayanan mikrobiyal tanı sistemine (MIS) göre teyit edilmiştir. Pseudomonas savastanoi pv. savastanoi izolatları tüm hücre yağ asitleri (FAME) komposizyonuna göre karşılaştırıldığında, fenotipik olarak %96.7, BOX-PCR’a dayanan küme analizlerine göre genotipik olarak %97.4 oranında birbirine benzerlik gösterdiği tespit edilmiştir.

Keywords

Zeytin dal kanseri, PCR, BOX-PCR, BIOLOG, MIS, FAME