Determination Occurrence of Tomato Spotted Wilt Virus (TSWV) Infection on Host Weed Species in Greenhouse Tomato and Pepper in the Mediterranean Region

Year 2024, Volume: 39 Issue: 1, 208 - 219, 28.06.2024

Pelin Keleş Öztürk , Şefika Yavuz , Hilmi Torun

Abstract

This study was planned to assess the frequency of weed species and the infection status of Tomato Spotted Wilt Virus (TSWV) in greenhouse cultivation areas of tomatoes and peppers during the fall and spring seasons from 2021 to 2022 in the Mediterranean Region. Surveys were conducted in 88 greenhouses, evaluating 1% of the total production area in the Mediterranean Region, with 37 different weed species to investigate the occurrence of TSWV infection. 1m2 frames were thrown in the sampling greenhouses to determine weed density (plants m-2) randomly. Weed species within the frames were sampled, and the presence of TSWV in these samples was investigated using the RT-qPCR method. Amaranthus retroflexus L., Amaranthus viridis L. and Erigeron canadensis L. were identified as the most prevalent species in the greenhouses. The RT-qPCR analysis for TSWV in weed samples revealed that Malva neglecta Wallr., Oxalis corniculata L., Melilotus officinalis (L.) Pall., Medicago polymorpha L., Parietaria judaica L., and Erigeron canadensis L. were identified as host weed species infected with TSWV. These findings indicate that weed populations in areas where tomatoes and peppers are grown in greenhouses serve as significant potential reservoirs for TSWV transmission to crops. Furthermore, they underscore the importance of weed control in greenhouse conditions for developing effective strategies to manage viral diseases.

Keywords

tomato spotted wilt virus, RT-qPCR, greenhouse, TSWV, vegetables

Project Number

TAGEM/BSAD/Ü/21/A2/P1/2564

Akdeniz Bölgesi Örtüaltı Domates ve Biber Alanlarında Tomato Spotted Wilt Virus (TSWV)’a Konukçu Yabancı Ot Türleri ile Enfeksiyon Durumunun Belirlenmesi

Abstract

Bu araştırma, 2021-2022 yılları güz ve bahar döneminde Akdeniz Bölgesi örtüaltı domates ve biber üretim alanlarında yaygın olarak görülen yabancı ot türlerinin ve tomato spotted wilt virus (TSWV) ile enfeksiyon durumunun belirlenmesi amacıyla planlanmıştır. Surveylerde Akdeniz Bölgesi üretim alanının %1’i olacak şekilde toplam 88 serada, 37 farklı yabancı ot türü üzerinde TSWV ile enfeksiyon durumu araştırılmıştır. Örneklenen seralarda tesadüfi 1 m2’lik çerçeveler atılmış ve yabancı ot yoğunluğu (adet/m2) belirlenmiştir. Çerçeve içerisine düşen yabancı ot türleri örneklenmiş ve bu örneklerde TSWV varlığı RT-qPCR yöntemi ile araştırılmıştır. Seralarda en yaygın türler Amaranthus spp. ve Conyza spp. olarak belirlenmiştir. Yabancı ot örneklerinde TSWV için yapılan RT-qPCR analizi sonucunda: Malva neglecta Wallr., Oxalis corniculata L., Melilotus officinalis (L.) Pall., Medicago polymorpha L., Parietaria judaica L. ve Conyza canadensis (L.) Cronquist yabancı ot türlerinin TSWV ile enfekteli olduğu belirlenmiştir. Bu bulgular, domates ve biber örtüaltı yetiştiriciliği yapılan alanlarda yabancı ot populasyonlarının TSWV'nin ürünlere taşınmasında önemli potansiyel rezervuar olduğunu göstermektedir. Ayrıca seralarda viral hastalık kontrol stratejilerinin oluşturulmasında yabancı ot mücadelesinin önemli olduğunu ortaya koymaktadır.

Keywords

biber, domates, TSWV, örtüaltı, yabancı ot

Supporting Institution

Tarımsal Araştırmalar ve Politikalar Genel Müdürlüğü

Project Number

TAGEM/BSAD/Ü/21/A2/P1/2564

Thanks

Bu çalışma Tarımsal Araştırmalar ve Politikalar Genel Müdürlüğü tarafından desteklenen TAGEM/BSAD/Ü/21/A2/P1/2564 numaralı projenin çalışmalarından ayrı bir çalışma olarak yürütülmüştür.

References

• Adkins, S. (2000). Tomato spotted wilt virus-positive steps towards negative success. Molecular Plant Pathology 1(3): 151-157.
• Akelma, Z., Gürbüz, R., Alptekin, H. (2022). Determination of weed problems in tomato prodution areas of Iğdır province in Türkiye. Turkish Journal of Weed Science 25(2): 111-121.
• Aksoy, E., Arslan, Z. F., Tetik, Ö., Eymirli, S. (2014). Domates tarlalarında sorun olan mısırlı canavar otunun [Phelipanche aegyptiaca (Pers.) Pomel] mücadelesinde bazı tuzak ve yakalayıcı bitkilerin allelopatik özelliklerinden yararlanma olanakları. Journal of Agricultural Sciences 20(2): 126-135.