Doktora derecesini de aldığı, Karadeniz Teknik Üniversitesi Deniz Bilimleri Fakültesi'nde 1990-2003 yılları arasında akademisyen olarak çalışmıştır. Doktora sonrası araştırmalarını, İngiltere’de Plymouth Marine Laboratuvarı (PML)'nda tamamlayan Dr. Nüket Sivri, Doçentlik aşamasında, kıyısal alanların çevresel etkileşimleri ve mikrobiyal değişimler, farklı çevresel ortamlarda antibiyotik direnç mekanizmaları ana başlıklarında proje ve çalışmalar yürütmüştür. Özellikle son 20 yıldır takip ettiği “İstanbul kıyısal alanında”, antropojenik baskılar ve etkileri konusunda farklı projelerde yürütücü ve araştırmacı olarak görev almıştır. Bölgesel ve küresel ölçekte sucul ekosistemler ile kıyı alanı çevresel etki değerlendirmesi, sucul ekosistemlerde antibakteriyel direnç, su sanitasyonu ve su kalitesi, iç-dış ortam mikrobiyal hava kalitesi ana çalışma konularıdır. Son dönemlerde çalışma ekibi ile dünyada güncel araştırma konuları olan “denizel ekosistemlerde endüstriyel ve evsel atık suların toksisitesinin tespitinde hızlı yöntemler geliştirmek” ve “mikroplastiklerin sucul mikroorganizmalar üzerindeki etkilerini belirlemek” üzerine hem ulusal ve hem de uluslararası nitelikte projelere odaklanmıştır. Bütüncül bir bakış açısı ile Tek Sağlık konusunda çalışmalar yürütmektedir. 

Veteriner Mikrobiyoloji Öğretim Üyesi

Dr. Mazlum's research and teaching is focused on developing new technological designs and creating alternative feed sources on the production of decapods (especially crayfish). He has more than 23 years of experience in this field to develop crayfish production and management practices. He got his Master and Doctorate degrees from the Department of Fisheries, Fisheries and Wildlife Biology at Clemson University in Clemson, USA. He did a minor in Statistical Sciences at Clemson University

https://avesis.omu.edu.tr/gciftci

AKADEMİK GÖREVLER
Prof. Dr. Sinop Üniversitesi Su Ürünleri Fakültesi 2007-
Prof. Dr. Ondokuz Mayıs Üniversitesi Su Ürünleri Fakültesi 2004-2007
Doç. Dr. Ondokuz Mayıs Üniversitesi Su Ürünleri Fakültesi 1999-2004
Yrd. Doç. Dr. Ondokuz Mayıs Üniversitesi Su Ürünleri Fakültesi 1997-1999
Arş. Gör. Ondokuz Mayıs Üniversitesi Su Ürünleri Fakültesi 1989-1997

ÖĞRENİM DURUMU
Doktora, Aberdeen Üniversitesi, Zooloji Departmanı, İskoçya, Birleşik Kırallık 1993-1996
Yüksek Lisans, Ondokuz Mayıs Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü 1990-1992
Su Ürünleri Temel Bilimler Bölümü
Lisans, Ondokuz Mayıs Üniversitesi, Sinop Su Ürünleri Yüksekokulu 1984-1988

ÇALIŞMA ALANLARI
(i) Ana alan: Ekotoksikoloji, Kirliliğin deniz omurgasızlarına etkileri, Deniz faunası ve florasında ağır metal seviyelerine dayalı araştırmalar,
(ii) diğer alanlar: Sediman kalitesi, Bentos, Karadeniz,
(iii) güncel araştırma alanları: Deniz Çöpleri ve Mikroplastikler



Önemli Çalışmaları
• Karadeniz Bölgesi'nin Biyolojik Çeşitliliği
• Türkiye'deki Karadeniz kirliliğine genel bakış
• Karadeniz'in gösterge organizmalarını kullanarak ağır metallerin ekosistem üzerindeki etkileri anlama çalışmaları
• Karadeniz'de ağır metallerin insan sağlığı risk değerlendirmesi
• Karadeniz'in güneyindeki kıyı yönetim planı
• Sediman ve su kalitelerinin mevsimsel çeşitliliğine karasal kökenli kirleticilerin etkileri
• Türkiye’nin Karadeniz kıyısındaki kirlilik kaynakları
• Karadeniz’in Sinop şehri balıkçılığı
• Karadeniz bölgesi boyunca yeni deniz koruma alanları için bir teklif
• Karadeniz bölgesi sedimanındaki ağır metal miktarları
• Karadeniz kıyılarında deniz çöpü ve mikro plastikler

1. Onuk, E.E., Çiftci, A., Findik, A. ve Y.Durmaz “Development and evaluation of multiplex polymerase chain reaction for identification of Flavobacterium psychrophilum, Yersinia ruckeri and Aeromonas salmonicida subsp. salmonicida in culture fisheries.” Journal of Veterinary Science, 11 (3): 235-241. (2010)
2. Özer, S., Börekçi, G., Bulduklu, P., Çiftci, A., Kanık, A. ve E.E. Onuk, “Evaluation of fluorescence in situ hybridization (FISH) and polymerase chain reaction (PCR) for identification of Enterococcus spp. isolated from fish and water.” The Israeli Journal of Aquaculture-Bamidgeh, 63: 643-651. (2011)
3. Onuk, E.E., Çiftçi, A., Fındık, A., Çiftçi, G., Altun, S., Balta, F., Özer, S. ve A.Y. Çoban, “Phenotypic and molecular characterization of Yersinia ruckeri isolates from Rainbow Trout (Oncorhynchus mykiss, Walbaum, 1792) in Turkey.” Berliner und Munchener Tierarztliche Wochenschrift, 124 (7-8): 320-328. (2011)
4. Didinen, B.I., Kubilay, A., Diler, O., Ekici, S., Onuk, E.E. ve A. Findik, “First isolation of Vagococcus salmoninarum from cultured rainbow trout (Oncorhynchus mykiss, Walbaum) broodstocks in Turkey.” Bullettin of The European Association of Fish Pathologists, 31 (6): 235-243. (2011)
5. Durmaz, Y., Onuk, E.E. ve A. Çiftçi, “Investigation of the presence and antibiotic susceptibilities of Flavobacterium psychrophilum in rainbow trout farms (Oncorhynchus mykiss Walbaum, 1792) in The Middle and Eastern Black Sea Regions of Turkey.” Ankara Üniversitesi Veteriner Fakültesi Dergisi, 59 (2): 141-146. (2012)
6. Altun, S., Onuk, E.E., Çiftci, A., Duman, M. ve A.G. Büyükekiz, “Determination of phenotypic, serotypic and genetic diversity and antibiotyping of Yersinia ruckeri isolated from Rainbow Trout.” Kafkas Üniversitesi Veteriner Fakültesi Dergisi, 19 (2): 225-232. (2013)
7. Onuk, E.E., Fındık, A., Turk, N., Altun, S., Korun, J., Ozer, S., Avsever, M.L. ve A. Ciftci, “Molecular identification and determination of some virulence genes of Aeromonas spp. in fish and water from Turkish coastal regions.” Revue de Medecine Veterinaire 164 (4): 200-206. (2013)
8. Altun, S., Onuk, E.E., Çiftci, A., Büyükekiz A.G. ve M. Duman, “Phenotipic, genotipic characterisation and antimicrobial susceptibility determination of Lactoccous garvieae strains.” Kafkas Universitesi Veteriner Fakültesi Dergisi, 19 (3): 375-381. (2013)
9. Pekmezci, G.Z., Bolukbas, C.S., Gurler, A.T. ve E.E. Onuk, “Occurrence and molecular characterization of Hysterothylacium aduncum (Nematoda: Anisakidae) from Merlangius merlangus euxinus and Trachurus trachurus off the Turkish coast of Black Sea.” Parasitology Research, 112 (3): 1031-1037. (2013)
10. Pekmezci, G.Z., Yardimci, B., Onuk, E.E. ve S. Umur, “Molecular characterization of Hysterothylacium fabri (Nematoda: Anisakidae) from Zeus faber (Pisces: Zeidae) caught off the Mediterranean coasts of Turkey based on nuclear ribosomal and mitochondrial DNA sequences.” Parasitology Internatıonal, 63 (1): 127-131. (2014)
11. Didinen, B.I., Yardımcı, B., Onuk, E.E., Metin, S. ve P. Yıldırım, “Naturally Lactococcus garvieae Infection in Rainbow Trout (Oncorhyncus mykiss Walbaum, 1792): New histopathological observations, phenotypic and molecular identification” Revue de Medecine Veterinaire, 165 (1-2): 12-19. (2014)
12. Pekmezci, G.Z., Onuk, E.E., Bolukbas, C.S., Yardimci, B., Gurler, A.T., Açıcı, M. ve S. Umur, “Molecular identification of Anisakis species (Nematoda: Anisakidae) from marine fishes collected in Turkish waters” Veterinary Parasitology 201 (1-2): 82-94. (2014)
13. Yardımcı, B., Pekmezci, G.Z. ve E.E. Onuk, “Pathology and molecular identification of Anisakis pegreffii infection in the John Dory, Zeus faber (Linnaeus, 1758) caught in Mediterranean Sea.” Ankara Üniversitesi Veteriner Fakültesi Dergisi, 61: 233-236. (2014)
14. Didinen, B.I., Metin, S., Onuk, E.E., Takmaz, H. ve A.T. Ersoy, “Isolation and characterization of potential probiotic bacteria from Rainbow Trout Oncorhynchus mykiss, (Walbaum) rearing units against bacterial pathogens.” The Israeli Journal of Aquaculture-Bamidgeh, 66: 1006-10014. (2014)
15. Metin, S., Kubilay, A., Onuk, E.E., Didinen, B.I., ve P. Yıldırım, “First isolation of Staphylococcus warneri from cultured Rainbow Trout (Oncorhynchus mykiss, Walbaum) broodstocks in Turkey.” Bullettin of The European Association of Fish Pathologists, 34(5): 165-174. (2014)
16. Onuk, E.E., Çaycı Y.T., Çoban A.Y., Çiftci A, Balta F, Didinen B.I., Pekmezci G.Z., Altun S., Ünlü M.S., ve A. Deveci, “Türkiye’de su kaynaklı Aeromonas izolatlarında saptanan ilk QnrS gen Pozitifliği.” Mikrobiyoloji Bülteni, 49 (1): 114-123 (2015)
17. Koca S.B.,Yigit N.Ö., Didinen B.I., Metin S., Bayrak H., Onuk E.E., İlhan İ., Eralp H., ve İ. Diler,. “Effects of Enzyme-Producing Probiotic Bacteria Isolated from the Gastrointestinal Tract of Trout on the Growth Performance, Survival and Digestive Enzyme Activity of Rainbow Trout Fry (Oncorhynchus mykiss).” The Israeli Journal of Aquaculture-Bamidgeh, 67: 1190, 10 pages. (2015)
18. Çiftçi, A., Onuk, E.E., Çiftçi, G., Fındık, A., Söğüt M.Ü., ve T. Gülhan, “The comparative analysis of phenotypic and genotypic properties of Aeromonas sobria strains isolated from rainbow trout (Oncorhynchus mykiss, Walbaum, 1972)” Kafkas Universitesi Veteriner Fakültesi Dergisi, 21(4): 585-592 (2015)
19. Muğlalı, ÖH., Salman, M., Gacar, A., Akdağ, F., Gülbahar, MY., Çiftçi, A., Onuk, EE., Karadaş, F., ve H. Eseceli, “In ovo feeding with β-hydroxy β-methylbutyrate on broiler performance, intestinal health and immunity status.” Turkish Journal of Veterinary and Anımal Sciences, 40 (1): 28-33 (2016).
20. Yardımcı, B., Didinen B.I., Onuk, E.E., Metin, S., Çiftçi, A., Kubilay, A., Pekmezci G.Z., ve H. Eralp, “Immunohistochemical evaluation of experimental Vagococcus salmoninarum infection in rainbow trout (Oncorhynchus mykiss, Walbaum 1792).” Journal of Fish Diseases, 39: 547-553, DOİ:10.1111/jfd.12386 (2016).
21. Çiftci, A., Onuk, E.E., Çiftci, G., Fındık, A., Söğüt, M.Ü., Didinen, B.I., Aksoy, A., Üstünakın, K., Gülhan, T., Balta, F., ve S. Altun, Development and validation of glycoprotein-based native-subunit vaccine for fish against Aeromonas hydrophila. Journal of Fish Diseases, 39 (8): 981-992, doi:10.1111/jfd.12499 (2016).
22. Didinen, B.I., Onuk, E.E., ve Sayı H, “In vitro testing of Potential Probiotic Bacteria against Vagococcus salmoninarum in Rainbow Trout (Oncorhynchus mykiss, Walbaum 1792).” The Israeli Journal of Aquaculture-Bamidgeh, IJA_68.2016.1317, 7 pages (2016)
23. Didinen, B.I., Onuk, E.E., Öztürk, T., Metin, S., Öz, M., Çaylı, Ö., ve Kubilay A, “First Report of Chryseobacterium sp. from Koi (Cyprinus carpio) in Turkey.” The Israeli Journal of Aquaculture-Bamidgeh, IJA_68.2016.1341, 8 pages (2016)
24. Onuk, E.E., Çaycı Y.T., Çoban A.Y., Çiftci A, Balta F, Didinen B.I., ve S. Altun, “Balık ve yetiştirme suyu kökenli Aeromonas izolatlarının antimikrobial duyarlılıklarının saptanması.” Ankara Üniversitesi Veteriner Fakültesi Dergisi, 63 (4): 69-73 (2017)
25. Didinen, B.I., Onuk, E.E., Metin, S., Çaylı, Ö. “Identification and characterization of lactic acid bacteria isolated from rainbow trout, (Oncorhynchus mykiss, Walbaum 1792), with inhibitory activity against Vagococcus salmoninarum and Lactococcus garvieae.” Aquaculture Nutrition. 24: 400-407 (2018)
26. Onuk EE, Didinen BI, Ciftci A, Yardımcı B, Pekmezci GZ. “Molecular characterisation of antibiotic resistance in Yersinia ruckeri isolates from Turkey.” Bullettin of The European Association of Fish Pathologists, 39(4): 145-155 (2019)
27. Kubilay A, Didinen BI, Metin S, Onuk EE, Bahadır S, Uluköy G. “First Record of Aeromonas sobria in Yellow Tail Cichlid, Pseudotropheus acei.” Bullettin of The European Association of Fish Pathologists, 40(1): 20-27 (2020)
28. Metin S, Onuk EE, Yardımcı B, Didinen BI. “First report of Candida sake isolated from cultured rainbow trout (Oncorhynchus mykiss, Walbaum) juveniles in Turkey.” Bullettin of The European Association of Fish Pathologists, 40(4): 141-147 (2020)
29. Pekmezci GZ, Yildirim A, Duzlu O, Simsek E, Balta F, Yardimci B, Onuk EE, Onder Z, Ciloglu A, Yetismis G, Yilmaz E, Inci A. (2022). Genetic diversity of Ichthyophthirius multifiliis (Fouquet, 1876) infecting farmed rainbow trout (Oncorhynchus mykiss Walbaum, 1792) in Turkey. Journal of Fish Diseases, 45(8), 1109–1115. https://doi.org/10.1111/jfd.13633
30. Saticioglu I, Onuk EE, Ay H, Ajmi N, Demirbas E, Altun S. (2023). Phenotypic and molecular differentiation of Lactococcus garvieae and Lactococcus petauri isolated fromtrout. Aquaculture, 577 (2023), 739933
31. Taha MD, Didinen BI, Onuk EE, Metin S, Yilmaz S, Mohamed AA, ... & Abdel-Latif HMR. (2023). Identification of four autochthonous yeasts from the intestines of goldfish, Carassius auratus with potential probiotic properties and their effects on the most common fish bacterial pathogens. Microbial Pathogenesis 184 (2023), 106381.
32. Berktaş OÇ, Didinen BI, Onuk EE, Yilmaz S, Abdel-Latif HMR. (2024) Identification of new yeast strains, Candida zeylanoides Y12-3 and Hyphopichia pseudoburtonii Y12-1, from the intestinal tract of rainbow trout, Oncorhynchus mykiss, with potential probiotic characteristics. The Journal of the World Aquaculture Society. https://doi.org/10.1111/jwas.13048

...

1986 yılında Atatürk Üniversitesi Ziraat Fakültesi’nden mezun oldu. Ziraat Bankası bünyesinde Ziraat Mühendisi olarak 1988-1993 yılları arasında 6 yıl görev yaptıktan sonra 1993 yılında Atatürk Üniversitesi Ziraat Fakültesi Su Ürünleri Bölümünde Araştırma Görevlisi olarak çalışmaya başladı. Aynı üniversitenin Su Ürünleri Anabilim Dalında 1993-2000 yılları arasında Yüksek Lisans ve Doktora Eğitimini tamamladı. Mustafa Kemal Üniversitesine 1998 yılında Araştırma Görevlisi olarak naklen atanmış olup, Su Ürünleri alanında 2000 yılında Yrd. Doç. Dr., 2002 yılında Doç. Dr. ve 2007 yılında Prof. Dr. Unvanlarını almıştır.
Uluslararası dergilerde 98 adet olmak üzere toplam 189 adet yayımlanmış bilimsel çalışması bulunan Prof. TÜRKMEN’in bilimsel yayınlarına uluslararası indeksli dergilerde yapılmış 4250 adet atıf bulunmaktadır. Diğer taraftan çok sayıda yüksek lisans ve doktora tezi yönetmiş olan Prof. Dr. Mustafa TÜRKMEN, Avrupa Birliği fonları, Tübitak ve DPT projeleri başta olmak üzere 63 adet projede yürütücü, araştırmacı, danışman ve eğitmen olarak yer almıştır. 12 adet ulusal, 33 adet uluslararası konferansa bildirileriyle katılan Prof. Dr. TÜRKMEN’in alanındaki uluslararası dergilerde 825 adet yayın hakemliği bulunmaktadır. Diğer taraftan, 2 tanesi baş editörlük olmak üzere 16 adet uluslararası dergide Editörlük görevini de yürütmektedir. Aynı şekilde 12 adet uluslararası kitap editörlüğü de bulunmaktadır.
Yaklaşık 42 adet lisansüstü öğrenci danışmanlığı yürütmüştür. Pek çok lisansüstü tez değerlendirmesinde de Jüri Üyesi olarak görev alan TÜRKMEN, Yrd. Doç., Doç. ve Prof. jürilerinde de görev yapmaktadır. Pek çok ulusal ve uluslararası ödüle sahip olan Prof. TÜRKMEN’ in aldığı ödüllerden bazıları şunlardır; 37 adet TÜBİTAK Uluslararası yayın teşvik ödülü, “Certificate of Reviewing Award 2015”, “Highly Cited Researchers Award-2016”, “Certified Centinel of Science Award Recipient 2016 ve 2018-as one of the top 10 per cent of researchers”, “Akademik ve Bilimsel Vizyon Ödülü 2016”, “Publons Peer Review Award 2017-as one of the top 1 per cent of peer review in Multidisciplinary”, yaklaşık 29 adet “Certificate of Excellence in Reviewing Award”. Ayrıca, Prof. Türkmen, Uluslararası toplantılarda, oturum başkanlığı, sempozyum koordinatörlüğü, düzenleme kurulu üyeliği, bilim kurulu üyeliği görevleri de yapmış olup, akademik ve bilimsel amaçla yaklaşık 18 ülkede bulunmuştur.
Halen Giresun Üniversitesi Biyoloji bölümünde Profesör olarak çalışmakta olan TÜRKMEN akademik hayatı boyunca uzun yıllar idarecilikler de yapmış olup, bunlardan bazıları; Rektör yardımcılığı, Mühendislik, Eğitim ve Spor Bilimleri Fakültesi dekanlıkları (12 yıl), çeşitli birimlerde bölüm ve Anabilim dalı başkanlıkları (25 yıl), Yüksekokul müdürlüğü olup, bazıları halen devam etmektedir.