Hakemler, makale değerlendirmeye başlamadan ve Editöre görüş bildirmeden önce "Yazım Kurallarını" ve "Etik İlkeleri" okumalıdır.
Makalenin incelenmesi tamamlandıktan sonra, makale değerlendirme formu dikkatle doldurulmalı ve görüşler, formun sonunda “Yazara Not” (veya tercih edilirse “Editöre Not”) kısmına ayrıntılı yazılmalıdır. Yorumun başına, birkaç cümle ile çalışmanın özeti, hedefi yazılmalı ve çalışma kapsamında elde edilen sonuç özetlenmelidir. Görüş yazmak için bu izlenceyi takip etmek iyi bir başlangıç olur. Bu iki amaca hizmet eder: Hem editöre çalışmanın detaylarını hatırlatır, hem de yazar ve editörün çalışma içeriğini hakemin anladığından emin olmalarını sağlar.
Her ne kadar yazar belirtiyor olsa da, çalışmanın türünün tam olarak hangisi olduğu konusunda hakem görüşü, değerlendirme formunun en başında “Makale Türü” başlığı altında hakem tarafından ayrıca farklı bir makale türü (örneğin; Araştırma, Derleme, Teknik Not, Editöre Mektup, Tartışma, Düzeltme) olarak önerilebilir. Makaleye özel detay görüş ve bilimsel yorum içermeyen genel ifadeler, değerlendirme olarak kabul edilmemekte, hakemlik iptal edilmektedir. Değerlendirmede çalışmanın kuvvetli ve zayıf yanları, veri kalitesi, kullanılan yöntem ve teknikler, şekil, tablo, sonuç ve yapılan yorumun niteliği, düzeltilmesi gereken kısımlar göz önünde bulundurulmalıdır. Hakem, yazar(lar)a iletilmek üzere sisteme ek dosya yükleyebilir. Makalenin ret gerekçesi bilimsel dile ve standartlara uygun açıklanmalıdır.
İntihal raporu yazar tarafından sisteme yüklenmektedir. Hakem, istemesi durumunda ayrıca bir kontrol yapabilir, farklı bir gelişme olması halinde durumu Editör’e bildirebilir.
Hakem(ler)e gönderilen word dosyası, hakem sürümüdür. Bu sürümde, çift-kör hakemlik politikası gereği sadece yazar ismi ve kurum bilgisi satırları silinmekle kalmamakta, word kelime işlemcisinde “Belge Denetçisi” penceresi kullanılarak “Belge Özellikleri ve Kişisel Bilgiler” de silinmektedir. Bu sayede hakem(ler) hiçbir surette “Yazar” veya yazar(lar) ile ilişkili olacak şekilde “Son Değiştiren” bilgilerini görememektedir. Aynı durum yazar(lar) için de geçerlidir. Yazar(lar) da hakem(ler)den gelen dosyalarda hiçbir surette hakem(ler)in kim olduğunu bilmemektedir.
“Editöre Not” kısmının doldurulması bir tercihtir, zorunlu değildir. Bu nedenle “Yazara Not” kısmına yazılanlar veya özet, kopyala-yapıştır ile burada bir kere daha tekrarlanmamalıdır. Bu kısım, ancak gerekmesi durumunda Editör'ü bilgilendirmek için kullanılmalıdır.