"Kocaeli Üniversitesi Fen Bilimleri Dergisi (KOUFBD)” ye gönderilen makaleler ve ilgili ek dosyalar, dergiye uygunluk ve yazım kuralları açısından editör tarafından değerlendirilir. Makale uygun değil ise Editör tarafından hakemlere gönderilmeden reddedilebilir. Uygun bulunan makaleler, makalenin bilimsel düzeyinin değerlendirilmesi için en az iki uzman hakeme gönderilir. Makalelerin dergimizde yayınlanabilmesi için belirli bilimsel standartları karşılaması beklenmektedir. KOUFBD, hakemlerin kimliklerinin yazarlara anonim kaldığı tek-kör inceleme sistemini benimsemektedir.
Hakemler makaleye ilişkin yorumlarıyla birlikte makalenin kabulünü, minör revizyonunu, majör revizyonunu veya reddini önerebilmektedir. Hakemlerin önerileri birbirine zıt ise editör tarafından üçüncü bir hakem ataması yapılabilmektedir. Editör, hakemlerin yorumlarını aldıktan sonra, hakemlerin yorumları ile birlikte, makale hakkındaki son kararı yazara bildirmelidir. Karar, makalenin düzeltilmesini gerektiriyorsa, ilgili yazarlar makalelerini editör tarafından belirtilen zamanda gözden geçirerek hakem yorumlarına göre makale revizyonlarını tamamlamak zorundadır. Daha sonra yazarlar, revize edilmiş makalelerini hakem yorumlarına verdikleri cevaplar ile birlikte tekrar dergi sistemine yüklemelidir. Revize makaleler, majör revizyon durumunda veya minör revizyon da olsa editörün gerekli görmesi durumunda yeniden hakemlere gönderilir. Kabul edilen makaleler, daha sonra prodüksiyon ve dil editörlerine gönderilerek kontrolleri yapılır.